RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273261.7

LRIG1-201, Transcript of leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRIG1, Length 5,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1-201ENST00000273261 SEPHS2Q99611 448 aa20.58■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 ZMYM5Q9UJ78 669 aa20.58■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 FBXO5Q9UKT4 447 aa20.58■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 BTBD19C9JJ37 291 aa20.57■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 MAGEC1O60732 1142 aa20.57■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 TFEBP19484 476 aa20.57■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa20.57■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 TSPAN1O60635 241 aa20.57■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 TBL1XO60907 577 aa20.57■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 NPY5RQ15761 445 aa20.57■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 FUKQ8N0W3 1084 aa20.57■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 PMM2O15305 246 aa20.57■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 HDAC3O15379 428 aa20.57■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 SERPINB1P30740 379 aa20.57■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 NCF4Q15080 339 aa20.57■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 SYT12Q8IV01 421 aa20.57■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 IQCKQ8N0W5 287 aa20.57■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 AADATQ8N5Z0 425 aa20.57■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 MAGED4Q96JG8 741 aa20.57■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 SYBUQ9NX95 663 aa20.57■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa20.57■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 DRD4P21917 467 aa20.57■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 LRPAP1P30533 357 aa20.57■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 PTPN9P43378 593 aa20.57■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 GRIA4P48058 902 aa20.57■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 INSCQ1MX18 579 aa20.57■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 LIPMQ5VYY2 423 aa20.57■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 PACS1Q6VY07 963 aa20.57■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa20.57■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 CSPG4P5Q96PW8 444 aa20.57■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 SLC39A8Q9C0K1 460 aa20.57■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 ANXA6P08133 673 aa20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 ALDH9A1P49189 494 aa20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 SLC16A1P53985 500 aa20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 SKP1P63208 163 aa20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 NECAB2Q7Z6G3 386 aa20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 FIBCD1Q8N539 461 aa20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 IKZF4Q9H2S9 585 aa20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 ZNF541Q9H0D2 1346 aa20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 MDM4O15151 490 aa20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 TNFAIP8O95379 198 aa20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 MFSD5Q6N075 450 aa20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 C1orf127Q8N9H9 656 aa20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 SPPL2AQ8TCT8 520 aa20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 PPP3R2Q96LZ3 170 aa20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 LIMD1Q9UGP4 676 aa20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 HPGDP15428 266 aa20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 MBTD1Q05BQ5 628 aa20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 C10orf53Q8N6V4 93 aa20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 LRRC57Q8N9N7 239 aa20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 A0A088AWK7 358 aa20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 ASGR1P07306 291 aa20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 CXCR2P25025 360 aa20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 PIK3R1P27986 724 aa20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 POU1F1P28069 291 aa20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 IRF8Q02556 426 aa20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 C1DQ13901 141 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 MFSD4BQ5TF39 518 aa20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 BTN2A3PQ96KV6 586 aa20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 TTPALQ9BTX7 342 aa20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 GLOD4Q9HC38 313 aa20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 CAPN10Q9HC96 672 aa20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 BRCC3P46736 316 aa20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 FLT3LGP49771 235 aa20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 SVOPQ8N4V2 548 aa20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 APOL4Q9BPW4 351 aa20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 C15orf41Q9Y2V0 281 aa20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 PAGE1O75459 146 aa20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 ABCG1P45844 678 aa20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 PURAQ00577 322 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 ITGA7Q13683 1181 aa20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 ITFG1Q8TB96 612 aa20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 SNX15Q9NRS6 342 aa20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 ATAD3AQ9NVI7 634 aa20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 KCNH1O95259 989 aa20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 PARNO95453 639 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
LRIG1-201ENST00000273261 PSMG1O95456 288 aa20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms