RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC166P0CW27 439 aa20.65■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 EPHA5P54756 1037 aa20.65■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 NR1H3Q13133 447 aa20.65■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 ARTNQ5T4W7 220 aa20.65■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa20.65■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 C1orf228Q6PIY5 440 aa20.65■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 CYP2S1Q96SQ9 504 aa20.65■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 ATXN3LQ9H3M9 355 aa20.65■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa20.65■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 DNPEPQ9ULA0 475 aa20.65■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa20.65■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 OLFM2O95897 454 aa20.65■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 STXBP5Q5T5C0 1151 aa20.65■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 PPP2R3CQ969Q6 453 aa20.65■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 NDE1Q9NXR1 346 aa20.65■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 DPP7Q9UHL4 492 aa20.65■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF148Q9UQR1 794 aa20.65■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 NOTCH4Q99466 2003 aa20.64■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 OR6B1O95007 311 aa20.64■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 TGM2P21980 687 aa20.64■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 CDC16Q13042 620 aa20.64■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 MANEALQ5VSG8 457 aa20.64■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 SATL1Q86VE3 508 aa20.64■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa20.64■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 TTC13Q8NBP0 860 aa20.64■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF398Q8TD17 642 aa20.64■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 BTN2A3PQ96KV6 586 aa20.64■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 EBF3Q9H4W6 596 aa20.64■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 VPS37BQ9H9H4 285 aa20.64■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 GKN1Q9NS71 199 aa20.64■□□□□ 0.9
UBE2B-201ENST00000265339 MYO9BQ13459 2157 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 XYLBO75191 536 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 RHOP08100 348 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 PTPN2P17706 415 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 CPA2P48052 419 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 HCAR3P49019 387 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 KCNC3Q14003 757 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 MS4A13Q5J8X5 152 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 SLC35B2Q8TB61 432 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 TCEAL4Q96EI5 215 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 GCNAQ96QF7 691 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 PRKD2Q9BZL6 878 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 PHACTR1Q9C0D0 580 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 SMPD4Q9NXE4 827 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 HEY1Q9Y5J3 304 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 DCLK1O15075 740 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 STC2O76061 302 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 USP1O94782 785 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 MAP3K6O95382 1288 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 SRGAP2BP0DMP2 458 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 GRIA2P42262 883 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 COG7P83436 770 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 NOMO1Q15155 1222 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 C14orf80Q86SX3 495 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 ARHGAP24Q8N264 748 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 SHKBP1Q8TBC3 707 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 REV3LO60673 3130 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 HDCP19113 662 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 CRABP2P29373 138 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 NTHL1P78549 312 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 GBE1Q04446 702 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 GPS1Q13098 491 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 LZICQ8WZA0 190 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 WBP2Q969T9 261 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 PLD4Q96BZ4 506 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 C1orf74Q96LT6 269 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF576Q9H609 170 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 CIDEBQ9UHD4 219 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 A0A1W2PPM1 405 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 IRF1P10914 325 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 ERCC2P18074 760 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 ARFIP2P53365 341 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 VCPP55072 806 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 OASLQ15646 514 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 NADSYN1Q6IA69 706 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 UNC45BQ8IWX7 931 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 E9PAM4 449 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 MFSD11O43934 449 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2B-201ENST00000265339 MOSPD3O75425 235 aa20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms