RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254976.6

SNAP25-201, Transcript of synaptosome associated protein 25, humanhuman

APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAP25, Length 2,053 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25-201ENST00000254976 FAM159BA6NKW6 160 aa13.05□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 SPAG7O75391 227 aa13.05□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 ZMPSTE24O75844 475 aa13.05□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 FGF19O95750 216 aa13.05□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 NPY2RP49146 381 aa13.05□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 TNK2Q07912 1038 aa13.05□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 MPP3Q13368 585 aa13.05□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 MPP2Q14168 576 aa13.05□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 TMEM25Q86YD3 366 aa13.05□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 C4orf33Q8N1A6 199 aa13.05□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 MZB1Q8WU39 189 aa13.05□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 RABEP2Q9H5N1 569 aa13.05□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 MLXIPLQ9NP71 852 aa13.05□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 FETUBQ9UGM5 382 aa13.05□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 XIRP2A4UGR9 3374 aa13.05□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 E2F8A0AVK6 867 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 GOLGA8RI6L899 631 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 ALDH1A2O94788 518 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 MT-CO1P00395 513 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 POLBP06746 335 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 INHBAP08476 426 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 GSTA2P09210 222 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 BRAFP15056 766 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 CHN1P15882 459 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 PFKLP17858 780 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 CD70P32970 193 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 MDH1P40925 334 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 LMAN2Q12907 356 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 MPPE1Q53F39 396 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 LRRC6Q86X45 466 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 TADA1Q96BN2 335 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 ZNF599Q96NL3 588 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 LRRC3BQ96PB8 259 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 IL22Q9GZX6 179 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 NOD2Q9HC29 1040 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 KCNK9Q9NPC2 374 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 VPS51Q9UID3 782 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 ZNF510Q9Y2H8 683 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 PSAT1Q9Y617 370 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 TMEM120BA0PK00 339 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 GOLGA8TH3BQL2 631 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 K7ERQ8 282 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 ATP5DP30049 168 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 SCNN1BP51168 640 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 BMPR2Q13873 1038 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 KCNC3Q14003 757 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 ZNF77Q15935 545 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 FYB2Q5VWT5 728 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 TAOK1Q7L7X3 1001 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 TMEM135Q86UB9 458 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 MGARPQ8TDB4 240 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 MGME1Q9BQP7 344 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 TRABDQ9H4I3 376 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 SEPT3Q9UH03 358 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 SOX13Q9UN79 622 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 WNT6Q9Y6F9 365 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 IKBKGQ9Y6K9 419 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 EYSQ5T1H1 3165 aa13.04□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 LINC01565O15544 149 aa13.03□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 USP1O94782 785 aa13.03□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 TMCC1O94876 653 aa13.03□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 PRKCGP05129 697 aa13.03□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 LRRC14Q15048 493 aa13.03□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 RASA2Q15283 850 aa13.03□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 SIRPB2Q5JXA9 342 aa13.03□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 SPANXN3Q5MJ09 141 aa13.03□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 SLC26A11Q86WA9 606 aa13.03□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 CCNJLQ8IV13 435 aa13.03□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 ANKRD42Q8N9B4 389 aa13.03□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP13.03□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 LEMD2Q8NC56 503 aa13.03□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 RSPRY1Q96DX4 576 aa13.03□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 CERS2Q96G23 380 aa13.03□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 PSKH2Q96QS6 385 aa13.03□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 AGAP2Q99490 1192 aa13.03□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 NAT9Q9BTE0 207 aa13.03□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa13.03□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa13.03□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa13.03□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 VIPR2P41587 438 aa13.03□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 SEPT6Q14141 434 aa13.03□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 GALNT3Q14435 633 aa13.03□□□□□ -0.32
SNAP25-201ENST00000254976 SLC1A5Q15758 541 aa13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms