RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 PTPN3P26045 913 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 ZBTB17Q13105 803 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 LBRQ14739 615 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 DLG2Q15700 870 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 KIAA1211LQ6NV74 962 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 C8orf74Q6P047 294 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 TSSK4Q6SA08 328 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 CAMKK1Q8N5S9 505 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 FAM71DQ8N9W8 422 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 PRRX2Q99811 253 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 RHOXF2Q9BQY4 288 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 SEPT10Q9P0V9 454 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 A0A1W2PQF6 199 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 K7ESF4 209 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 RNF103O00237 685 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 JCHAINP01591 159 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 PTGIRP43119 386 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 RENBPP51606 427 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 MARC1Q5VT66 337 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 ANO7Q6IWH7 933 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 GRK7Q8WTQ7 553 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 VAT1Q99536 393 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 MTG2Q9H4K7 406 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP19.77■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 AMACRQ9UHK6 382 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXD11-201ENST00000249504 C5orf60A6NFR6 353 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 K7ERQ8 282 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 TMCC1O94876 653 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 MMP13P45452 471 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 NRLP54845 237 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 CYTH1Q15438 398 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 TEX44Q53QW1 395 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 C22orf39Q6P5X5 142 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 PGBD3Q8N328 593 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 HMGB4Q8WW32 186 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 ANKRD7Q92527 254 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 CEP41Q9BYV8 373 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 FBRSQ9HAH7 460 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 PRSS16Q9NQE7 514 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 SEPT3Q9UH03 358 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 ANKRD36A6QL64 1941 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 BNIP3LO60238 219 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 SIN3BO75182 1162 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 GCATO75600 419 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 STK10O94804 968 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 ECEL1O95672 775 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 P3H1Q32P28 736 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 FAM182AQ5T1J6 154 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 Q6ZVU0 165 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 GSTA5Q7RTV2 222 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF567Q8N184 647 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 CNTD1Q8N815 330 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 GLIS1Q8NBF1 620 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 OR2T3Q8NH03 318 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 FRS2Q8WU20 508 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 TEKT5Q96M29 485 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 PSKH2Q96QS6 385 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 PARD6BQ9BYG5 372 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 CEP44Q9C0F1 390 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 TRHDEQ9UKU6 1024 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 NEU2Q9Y3R4 380 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 GAS8O95995 478 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 IFNB1P01574 187 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 HLA-DQB2P05538 268 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 PXNP49023 591 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 DR1Q01658 176 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF235Q14590 738 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 MAATS1Q7Z4T9 603 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 BBS5Q8N3I7 341 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 PGBD5Q8N414 524 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC89Q8N998 374 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 MDGA1Q8NFP4 955 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC110Q8TBZ0 833 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 PTPRN2Q92932 1015 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 SPATA13Q96N96 652 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 LRRC1Q9BTT6 524 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 LHX3Q9UBR4 397 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms