RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592763.5

ILF3-222, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 5 BASIC

Gene ILF3, Length 3,866 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-222	ENST00000592763	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		11	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		11	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	DIAPH2	O60879	1101 aa		11	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	ITGB8	P26012	769 aa		11	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	NPY2R	P49146	381 aa		11	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		11	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		11	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		11	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		11	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	POF1B	Q8WVV4	589 aa		11	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	E2F7	Q96AV8	911 aa		11	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		11	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		11	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		11	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	TP73	O15350	636 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	CTPS1	P17812	591 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	NNMT	P40261	264 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	SERPINB4	P48594	390 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	STX3	Q13277	289 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	GPNMB	Q14956	572 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	CNTD1	Q8N815	330 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	NT5C3B	Q969T7	300 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	KLHL29	Q96CT2	875 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	ZNF333	Q96JL9	665 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	SEPT3	Q9UH03	358 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	PSAT1	Q9Y617	370 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	EFCAB14	O75071	495 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	ITGA2B	P08514	1039 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	GLDC	P23378	1020 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	PLK1	P53350	603 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	ARFIP2	P53365	341 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	CSHL1	Q14406	222 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	PTPRCAP	Q14761	206 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	TAZ	Q16635	292 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	NEPRO	Q6NW34	567 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	HDAC10	Q969S8	669 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	RNF38	Q9H0F5	515 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763		E5RI56	91 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	MYO1C	O00159	1063 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	AP3B1	O00203	1094 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	NEMP1	O14524	444 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	NDUFS3	O75489	264 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	HCAR3	P49019	387 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	SCAP	Q12770	1279 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	PCID2	Q5JVF3	399 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	PACS1	Q6VY07	963 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	ERP27	Q96DN0	273 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	MAGEB18	Q96M61	343 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	TBX21	Q9UL17	535 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	TGM5	O43548	720 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	SLC22A12	Q96S37	553 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	ZNF358	Q9NW07	568 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	10.98	□□□□□ -0.65	6e-8	■□□□□ 11.1
ILF3-222	ENST00000592763	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	OR51F1	A6NGY5	319 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	GIPC1	O14908	333 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	CHRM3	P20309	590 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	CDK18	Q07002	472 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	ITGA9	Q13797	1035 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	UGP2	Q16851	508 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	ADGRF1	Q5T601	910 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	TPGS2	Q68CL5	300 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	APOPT1	Q96IL0	206 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	OLFM3	Q96PB7	478 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	BBS2	Q9BXC9	721 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	ABCG8	Q9H221	673 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-222	ENST00000592763	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		10.98	□□□□□ -0.65

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