RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 MAGEB5Q9BZ81 275 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 DDIT4Q9NX09 232 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 OR6C75A6NL08 312 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 CREB3O43889 395 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 MOSPD3O75425 235 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 OR4Q2P0C623 313 aa25.9■■□□□ 1.74
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CAPNS1-204ENST00000587718 TSPY1Q01534 308 aa25.9■■□□□ 1.74
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CAPNS1-204ENST00000587718 TWF1Q12792 350 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 RIPK1Q13546 671 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 C4orf50Q6ZRC1 276 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM47EQ6ZV65 393 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 HS6ST3Q8IZP7 471 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 FITM2Q8N6M3 262 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 C10orf82Q8WW14 230 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 CRISPLD1Q9H336 500 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa25.9■■□□□ 1.74
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CAPNS1-204ENST00000587718 USP17L7P0C7H9 530 aa25.9■■□□□ 1.74
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CAPNS1-204ENST00000587718 NCALDP61601 193 aa25.9■■□□□ 1.74
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF567Q8N184 647 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa25.9■■□□□ 1.74
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CAPNS1-204ENST00000587718 SIT1Q9Y3P8 196 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 MYO15AQ9UKN7 3530 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-204ENST00000587718 MGRN1O60291 552 aa25.89■■□□□ 1.73
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CAPNS1-204ENST00000587718 FCARP24071 287 aa25.89■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 CRHR1P34998 444 aa25.89■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 ANGPT1Q15389 498 aa25.89■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC44A4Q53GD3 710 aa25.89■■□□□ 1.73
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CAPNS1-204ENST00000587718 ARMC3Q5W041 872 aa25.89■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 TANGO2Q6ICL3 276 aa25.89■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 OVOS1Q6IE37 1185 aa25.89■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 CYB5D1Q6P9G0 228 aa25.89■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNK16Q96T55 309 aa25.89■■□□□ 1.73
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CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC3Q9BY71 257 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 ECT2Q9H8V3 914 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC17A7Q9P2U7 560 aa25.88■■□□□ 1.73
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CAPNS1-204ENST00000587718 MAGEB16A2A368 324 aa25.87■■□□□ 1.73
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CAPNS1-204ENST00000587718 DCNP07585 359 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
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CAPNS1-204ENST00000587718 ELMOD1Q8N336 334 aa25.87■■□□□ 1.73
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CAPNS1-204ENST00000587718 TSGA13Q96PP4 275 aa25.87■■□□□ 1.73
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CAPNS1-204ENST00000587718 ABCC13Q9NSE7 274 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM30AQ9NV96 361 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 UNC5CO95185 931 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 CSH1P0DML2 217 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 CSH2P0DML3 217 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 HOXC13P31276 330 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 CACNA2D1P54289 1103 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-204ENST00000587718 PFKPQ01813 784 aa25.86■■□□□ 1.73
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