RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 IQCDQ96DY2 449 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM11Q96F44 468 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 PPP1R16AQ96I34 528 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 SERAC1Q96JX3 654 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 SLC6A18Q96N87 628 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 HEPHQ9BQS7 1158 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 SYT11Q9BT88 431 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 TM6SF2Q9BZW4 377 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 CEP44Q9C0F1 390 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 TTYH3Q9C0H2 523 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 IL21RQ9HBE5 538 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 OSGEPQ9NPF4 335 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 TM7SF3Q9NS93 570 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 DONSONQ9NYP3 566 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 CAPN11Q9UMQ6 739 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 SNX11Q9Y5W9 270 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 ACTL7AQ9Y615 435 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 SCINQ9Y6U3 715 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 CHD5Q8TDI0 1954 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 EPG5Q9HCE0 2579 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PQJ5 194 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM191CA6NGB0 347 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 CBFA2T2O43439 604 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 KDELR3O43731 214 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 LEFTY1O75610 366 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 ZMPSTE24O75844 475 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 PCDH8O95206 1070 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 SERPING1P05155 500 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 CTSLP07711 333 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 CD59P13987 128 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 CD38P28907 300 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 SCAPQ12770 1279 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 ERMARDQ5T6L9 678 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 FBXL19Q6PCT2 694 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 NAXDQ8IW45 347 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 TMIEQ8NEW7 156 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 C1orf216Q8TAB5 229 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 RHBDD1Q8TEB9 315 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 CAMK1GQ96NX5 476 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 KDM4CQ9H3R0 1056 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 TSPY26PQ9H489 355 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF212Q9UDV6 495 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 AP4E1Q9UPM8 1137 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 USP24Q9UPU5 2620 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 UQCRHLA0A096LP55 91 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PQU0 124 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 UPK3BL1B0FP48 263 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 RASA4BC9J798 803 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 UPK3BL2E5RIL1 263 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 KRIT1O00522 736 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 NEMP1O14524 444 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 VILLO15195 856 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 SLC31A1O15431 190 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 RASA4O43374 803 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 MAGEC1O60732 1142 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 UQCRHP07919 91 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 TPM1P09493 284 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 PMLP29590 882 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 MIPP30301 263 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 CASP14P31944 242 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 GKP32189 559 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 PBX1P40424 430 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 SSR1P43307 286 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 NEK3P51956 506 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 PPP2CBP62714 309 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 PPP2CAP67775 309 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 IL9RQ01113 521 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 BNC1Q01954 994 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 RAD51Q06609 339 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 PARP15Q460N3 678 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC122Q5T0U0 273 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 ARTNQ5T4W7 220 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.7 ms