RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570484.1

CTDNEP1-204, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTDNEP1, Length 393 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-204ENST00000570484 ATP9BO43861 1147 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 SNAP91O60641 907 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 MAFKO60675 156 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 TMCC1O94876 653 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 KAT7O95251 611 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 IGSF6O95976 241 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 KRT14P02533 472 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 RHOXF2BP0C7M4 288 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 VAV1P15498 845 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 CA4P22748 312 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 GRIA2P42262 883 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 MAPK8P45983 427 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 KCNJ1P48048 391 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 SOX9P48436 509 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 BASP1P80723 227 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 ECT2LQ008S8 904 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 FOXC1Q12948 553 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 PTK6Q13882 451 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 OASLQ15646 514 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 ACCSLQ4AC99 568 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 CFAP58Q5T655 872 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 TTC27Q6P3X3 843 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 LINGO4Q6UY18 593 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 C4orf22Q6V702 233 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 LEKR1Q6ZMV7 388 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 TPRG1Q6ZUI0 275 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 TP53INP2Q8IXH6 220 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 MMGT1Q8N4V1 131 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 OR52K2Q8NGK3 314 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 UBXN4Q92575 508 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 TSGA13Q96PP4 275 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 ASB2Q96Q27 587 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 RHOXF2Q9BQY4 288 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 TRIM51Q9BSJ1 452 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 FSD1LQ9BXM9 530 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 CEP41Q9BYV8 373 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 TRIM31Q9BZY9 425 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 C10orf88Q9H8K7 445 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 NT5MQ9NPB1 228 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 HEBP1Q9NRV9 189 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 PCYOX1Q9UHG3 505 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 CLEC4EQ9ULY5 219 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 PLA2G4CQ9UP65 541 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 TRANK1O15050 2925 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 F5H423 210 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 MAN2B1O00754 1011 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 TIMM44O43615 452 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 NARSO43776 548 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 BNIP3LO60238 219 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 ANXA9O76027 345 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 JCHAINP01591 159 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 DLDP09622 509 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 GLULP15104 373 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 DRD1P21728 446 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 GLDCP23378 1020 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 MCM3P25205 808 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 PTPN3P26045 913 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 FDFT1P37268 417 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 ADCY8P40145 1251 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 OPRD1P41143 372 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 PLK1P53350 603 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 GDF10P55107 478 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 SEC13P55735 322 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 ARF5P84085 180 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 RAD51Q06609 339 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 SLC20A2Q08357 652 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 GPS1Q13098 491 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 ZBTB17Q13105 803 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 LRRC32Q14392 662 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 STARD3Q14849 445 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 PON2Q15165 354 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 GEN1Q17RS7 908 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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