RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	21.26	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		21.26	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		21.25	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		21.25	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		21.25	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		21.25	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	21.25	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		21.25	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	21.25	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	ACACB	O00763	2458 aa		21.25	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	OPHN1	O60890	802 aa		21.25	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	TMCC1	O94876	653 aa		21.25	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	WNT1	P04628	370 aa		21.25	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		21.25	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	21.25	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	GRIA4	P48058	902 aa		21.25	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	21.25	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	21.25	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	TRIM14	Q14142	442 aa		21.25	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		21.25	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	PARP15	Q460N3	678 aa		21.25	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	21.25	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		21.25	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		21.25	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		21.25	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	21.25	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	NPW	Q8N729	165 aa		21.25	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		21.25	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	21.25	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		21.25	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	21.25	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	21.25	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		21.25	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		21.25	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		21.25	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		21.25	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		21.24	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	21.24	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		21.24	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	BUB1	O43683	1085 aa		21.24	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	MFAP3L	O75121	409 aa		21.24	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	ADRB1	P08588	477 aa		21.24	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	21.24	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	21.24	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	21.24	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	21.24	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	DPYS	Q14117	519 aa		21.24	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	HLA-B	Q31612	363 aa		21.24	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	21.24	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	21.24	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	AFMID	Q63HM1	303 aa		21.24	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		21.24	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	21.24	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		21.24	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	PLPP6	Q8IY26	295 aa		21.24	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	21.24	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	CHP1	Q99653	195 aa		21.24	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	HDAC8	Q9BY41	377 aa		21.24	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		21.24	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	GAREM1	Q9H706	876 aa		21.24	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		21.24	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		21.24	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996		A0A1W2PR77	199 aa		21.23	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	KCNK3	O14649	394 aa		21.23	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	GSR	P00390	522 aa		21.23	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	ERCC2	P18074	760 aa		21.23	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	21.23	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	21.23	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	21.23	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	ACAP1	Q15027	740 aa		21.23	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	DPYSL2	Q16555	572 aa		21.23	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	SLC18A3	Q16572	532 aa		21.23	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	SARM1	Q6SZW1	724 aa		21.23	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	21.23	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	TRIM69	Q86WT6	500 aa		21.23	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		21.23	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		21.23	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		21.23	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		21.23	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	ZWILCH	Q9H900	591 aa		21.23	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	PDF	Q9HBH1	243 aa		21.23	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		21.23	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	PLXNA2	O75051	1894 aa		21.22	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	21.22	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996		J3KR12	359 aa		21.22	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	RARA	P10276	462 aa		21.22	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	ITGB7	P26010	798 aa		21.22	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	CTSK	P43235	329 aa		21.22	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	NDST2	P52849	883 aa		21.22	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	FAM193A	P78312	1265 aa		21.22	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	21.22	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	21.22	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	CYTH1	Q15438	398 aa		21.22	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	TEAD4	Q15561	434 aa		21.22	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	21.22	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	SERAC1	Q96JX3	654 aa		21.22	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		21.22	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	PREB	Q9HCU5	417 aa		21.22	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		21.22	■□□□□ 0.99
CS-222	ENST00000550996	LHX3	Q9UBR4	397 aa		21.22	■□□□□ 0.99

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