RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513274.5

COPB2-211, Transcript of coatomer protein complex subunit beta 2, humanhuman

TSL 3

Gene COPB2, Length 729 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2-211ENST00000513274 DNAI1Q9UI46 699 aa11.69□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa11.69□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa11.69□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 WASF2Q9Y6W5 498 aa11.69□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 ILVBLA1L0T0 632 aa11.68□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 RAD51BO15315 384 aa11.68□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 RRP8O43159 456 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 ZMPSTE24O75844 475 aa11.68□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 GFPT2O94808 682 aa11.68□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 GIMD1P0DJR0 217 aa11.68□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 ADRB3P13945 408 aa11.68□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 KLK7P49862 253 aa11.68□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 NEK3P51956 506 aa11.68□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 ARF5P84085 180 aa11.68□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 GNA12Q03113 381 aa11.68□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 ILKQ13418 452 aa11.68□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 FGL2Q14314 439 aa11.68□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 RTP5Q14D33 572 aa11.68□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 ARTNQ5T4W7 220 aa11.68□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 RETSATQ6NUM9 610 aa11.68□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 NEK5Q6P3R8 708 aa11.68□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 SLC30A5Q8TAD4 765 aa11.68□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 PPP1R16AQ96I34 528 aa11.68□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 FEM1CQ96JP0 617 aa11.68□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 APOLD1Q96LR9 279 aa11.68□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 HAPLN3Q96S86 360 aa11.68□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 HDAC8Q9BY41 377 aa11.68□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 VPS16Q9H269 839 aa11.68□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 TAB2Q9NYJ8 693 aa11.68□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 GGT7Q9UJ14 662 aa11.68□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 TMEM59LQ9UK28 342 aa11.68□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 ITM2BQ9Y287 266 aa11.68□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa11.67□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 IGLON5A6NGN9 336 aa11.67□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 A6NNZ2 444 aa11.67□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 FAM72CH0Y354 149 aa11.67□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 NEMP1O14524 444 aa11.67□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 MPOP05164 745 aa11.67□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 UCHL3P15374 230 aa11.67□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 L1CAMP32004 1257 aa11.67□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 CLCN6P51797 869 aa11.67□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 NOMO3P69849 1222 aa11.67□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 E2F1Q01094 437 aa11.67□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 KIF26BQ2KJY2 2108 aa11.67□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 TMEM259Q4ZIN3 620 aa11.67□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 LRRC73Q5JTD7 316 aa11.67□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 FAM72AQ5TYM5 149 aa11.67□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 FAM72DQ6L9T8 149 aa11.67□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 FAM72BQ86X60 149 aa11.67□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 ZNF354CQ86Y25 554 aa11.67□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 JOSD2Q8TAC2 188 aa11.67□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 RXFP2Q8WXD0 754 aa11.67□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 FGF11Q92914 225 aa11.67□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 ABCG4Q9H172 646 aa11.67□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 CLSTN2Q9H4D0 955 aa11.67□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 NLRC4Q9NPP4 1024 aa11.67□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 ZNF212Q9UDV6 495 aa11.67□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 OR12D3Q9UGF7 316 aa11.67□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 FADS3Q9Y5Q0 445 aa11.67□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa11.67□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 RP1P56715 2156 aa11.67□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 CHD5Q8TDI0 1954 aa11.67□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa11.66□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 CPED1A4D0V7 1026 aa11.66□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 C16orf96A6NNT2 1141 aa11.66□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 K7ESM1 405 aa11.66□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 KRIT1O00522 736 aa11.66□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 OPA1O60313 960 aa11.66□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 CD160O95971 181 aa11.66□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 ALPPL2P10696 532 aa11.66□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 ITIH2P19823 946 aa11.66□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 SCNN1AP37088 669 aa11.66□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 ABL2P42684 1182 aa11.66□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 RPS21P63220 83 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 SLC20A2Q08357 652 aa11.66□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 SGCGQ13326 291 aa11.66□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 FZD2Q14332 565 aa11.66□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 DEFB133Q30KQ1 61 aa11.66□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 CCDC14Q49A88 953 aa11.66□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 TPRG1LQ5T0D9 272 aa11.66□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 CRTC1Q6UUV9 634 aa11.66□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa11.66□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa11.66□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 MSANTD4Q8NCY6 345 aa11.66□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 GPT2Q8TD30 523 aa11.66□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 EPS8L1Q8TE68 723 aa11.66□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 BAP1Q92560 729 aa11.66□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 C11orf70Q9BRQ4 267 aa11.66□□□□□ -0.54
COPB2-211ENST00000513274 STK33Q9BYT3 514 aa11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms