RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509638.5

LIMCH1-211, Transcript of LIM and calponin homology domains 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMCH1, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMCH1-211ENST00000509638 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 DTWD2Q8NBA8 298 aa30.1■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 OR2A12Q8NGT7 310 aa30.1■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 MAIP1Q8WWC4 291 aa30.1■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 CCDC114Q96M63 670 aa30.1■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 ANKRD36A6QL64 1941 aa30.09■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 CXCL12P48061 93 aa30.09■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 RENBPP51606 427 aa30.09■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 TSTD1Q8NFU3 115 aa30.09■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 ACTRT1Q8TDG2 376 aa30.09■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 PSKH2Q96QS6 385 aa30.09■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 C10orf88Q9H8K7 445 aa30.09■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 MUSKO15146 869 aa30.08■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 GSRP00390 522 aa30.08■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 ZBTB17Q13105 803 aa30.08■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 MAMSTRQ6ZN01 415 aa30.08■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 CACUL1Q86Y37 369 aa30.08■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 STK40Q8N2I9 435 aa30.08■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 BBS5Q8N3I7 341 aa30.08■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 TEX26Q8N6G2 289 aa30.08■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 OR2AP1Q8NGE2 309 aa30.08■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 OR6K2Q8NGY2 324 aa30.08■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 C1orf54Q8WWF1 131 aa30.08■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 CAPZA3Q96KX2 299 aa30.08■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa30.08■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 CEP41Q9BYV8 373 aa30.08■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 DNPEPQ9ULA0 475 aa30.08■■■□□ 2.41
LIMCH1-211ENST00000509638 IGSF6O95976 241 aa30.07■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa30.07■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 SLC35B2Q8TB61 432 aa30.07■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 TTLL3Q9Y4R7 772 aa30.07■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 NEBLO76041 1014 aa30.07■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 RBL1P28749 1068 aa30.07■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 RGRP47804 291 aa30.07■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 COPAP53621 1224 aa30.07■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 CARD16Q5EG05 197 aa30.07■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 C1orf210Q8IVY1 113 aa30.07■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 PGBD5Q8N414 524 aa30.07■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 OR2T3Q8NH03 318 aa30.07■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 HMGB4Q8WW32 186 aa30.07■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 HTR3CQ8WXA8 447 aa30.07■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 OR8D1Q8WZ84 308 aa30.07■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 FBRSQ9HAH7 460 aa30.07■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 NT5MQ9NPB1 228 aa30.07■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP30.07■■■□□ 2.4
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LIMCH1-211ENST00000509638 LIASO43766 372 aa30.06■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 JCHAINP01591 159 aa30.06■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 FAM182AQ5T1J6 154 aa30.06■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 ANO7Q6IWH7 933 aa30.06■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 CHST14Q8NCH0 376 aa30.06■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 MGME1Q9BQP7 344 aa30.06■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 SLC6A17Q9H1V8 727 aa30.06■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 K7ESF4 209 aa30.05■■■□□ 2.4
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LIMCH1-211ENST00000509638 MTSS1O43312 755 aa30.05■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 APBB3O95704 486 aa30.05■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 HLA-DQB2P05538 268 aa30.05■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 NDUFV2P19404 249 aa30.05■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 MAXP61244 160 aa30.05■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa30.05■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 IL12RB2Q99665 862 aa30.05■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa30.05■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 ALOX15BO15296 676 aa30.04■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 GJB3O75712 270 aa30.04■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 GABRG2P18507 467 aa30.04■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 PTPN3P26045 913 aa30.04■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 WASHC5Q12768 1159 aa30.04■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 SNX1Q13596 522 aa30.04■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 CREG2Q8IUH2 290 aa30.04■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 PLPP6Q8IY26 295 aa30.04■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 MDGA1Q8NFP4 955 aa30.04■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 ZNF592Q92610 1267 aa30.04■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 AP1M1Q9BXS5 423 aa30.04■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP30.04■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
LIMCH1-211ENST00000509638 KRIT1O00522 736 aa30.03■■■□□ 2.4
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