RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495615.5

CBWD5-231, Transcript of COBW domain containing 5, human

TSL 3

Gene CBWD5, Length 993 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CBWD5-231	ENST00000495615		Q6ZTK2	550 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	SERPINA11	Q86U17	422 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	TRIM74	Q86UV6	250 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	TRIM73	Q86UV7	250 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	RNFT2	Q96EX2	444 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	LUZP4	Q9P127	313 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615		A0A096LPK6	155 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	INAFM1	C9JVW0	142 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	STMND1	H3BQB6	276 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	EYA2	O00167	538 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	CHRNB2	P17787	502 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	HNF1B	P35680	557 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	AVPR1A	P37288	418 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	GPD2	P43304	727 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	GPR18	Q14330	331 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	SYTL3	Q4VX76	610 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	ZNF585B	Q52M93	769 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	KLHL22	Q53GT1	634 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	ATG16L1	Q676U5	607 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	PDXDC1	Q6P996	788 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	TRIL	Q7L0X0	811 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	STAM	Q92783	540 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	REEP2	Q9BRK0	252 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	ZPBP	Q9BS86	351 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	RGS14	O43566	566 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	SERPINC1	P01008	464 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	CHRM4	P08173	479 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	ARSB	P15848	533 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	TNFRSF8	P28908	595 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	DPP6	P42658	865 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	PMS2	P54278	862 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	ZP1	P60852	638 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	GPS2	Q13227	327 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	DUSP6	Q16828	381 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	NAA35	Q5VZE5	725 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615		Q6ZSV7	163 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	BBS12	Q6ZW61	710 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	PPM1E	Q8WY54	764 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	HSPH1	Q92598	858 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	KLHL31	Q9H511	634 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	PLK2	Q9NYY3	685 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CBWD5-231	ENST00000495615	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	LACTBL1	A8MY62	500 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	MS4A18	H0YCH9	400 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	NPHP1	O15259	732 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	SLC28A2	O43868	658 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	PGM1	P36871	562 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	MAPK9	P45984	424 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	PPP3CC	P48454	512 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	CDH12	P55289	794 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	ABAT	P80404	500 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	TLE2	Q04725	743 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	5.02	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	CADM3	Q8N126	398 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	SETD9	Q8NE22	299 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	CEP76	Q8TAP6	659 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	NEUROG1	Q92886	237 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	OTULIN	Q96BN8	352 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	APOLD1	Q96LR9	279 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	FZD10	Q9ULW2	581 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	VWA5A	O00534	786 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	HSPB6	O14558	160 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CBWD5-231	ENST00000495615	VAMP2	P63027	116 aa		5.01	□□□□□ -1.61

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