RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487547.1

USP34-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, humanhuman

TSL 3

Gene USP34, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34-216ENST00000487547 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 ITGB6P18564 788 aa6.38□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 ARRB2P32121 409 aa6.38□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 CCKARP32238 428 aa6.38□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 UBE3AQ05086 875 aa6.38□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 TRAF2Q12933 501 aa6.38□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 BIRC3Q13489 604 aa6.38□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 RPE65Q16518 533 aa6.38□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 FSCBQ5H9T9 825 aa6.38□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 WDR45BQ5MNZ6 344 aa6.38□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 FBXL14Q8N1E6 418 aa6.38□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 IQCF1Q8N6M8 205 aa6.38□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 TEX45Q8NA69 505 aa6.38□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 ASB5Q8WWX0 329 aa6.38□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 DCLK3Q9C098 648 aa6.38□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 ALKBH4Q9NXW9 302 aa6.38□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 FZD10Q9ULW2 581 aa6.38□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 TTC3P53804 2025 aa6.38□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 A0A0A0MQY5 61 aa6.37□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 ASAP2O43150 1006 aa6.37□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 GUCY1B2O75343 617 aa6.37□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 TKTP29401 623 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 GPD2P43304 727 aa6.37□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 HTR6P50406 440 aa6.37□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 SLC18A3Q16572 532 aa6.37□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.37□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 FNBP1LQ5T0N5 605 aa6.37□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 NAA35Q5VZE5 725 aa6.37□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 BBS12Q6ZW61 710 aa6.37□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 SMC5Q8IY18 1101 aa6.37□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 RBFAQ8N0V3 343 aa6.37□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 DNAAF1Q8NEP3 725 aa6.37□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa6.37□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 OIT3Q8WWZ8 545 aa6.37□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 WDR26Q9H7D7 661 aa6.37□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.36□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 BECN2A8MW95 431 aa6.36□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 GNLYP22749 145 aa6.36□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 PPP3CCP48454 512 aa6.36□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 TMPRSS3P57727 454 aa6.36□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 EGR4Q05215 589 aa6.36□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 DCAF6Q58WW2 860 aa6.36□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 IL20RBQ6UXL0 311 aa6.36□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 ZNF367Q7RTV3 350 aa6.36□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 TRIM74Q86UV6 250 aa6.36□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 TRIM73Q86UV7 250 aa6.36□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 CPXCR1Q8N123 301 aa6.36□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 OR4N2Q8NGD1 307 aa6.36□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 STAMQ92783 540 aa6.36□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 CAMK1GQ96NX5 476 aa6.36□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.36□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 NLKQ9UBE8 527 aa6.36□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 MYO6Q9UM54 1294 aa6.36□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 LIASO43766 372 aa6.35□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 LCATP04180 440 aa6.35□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 CENPAP49450 140 aa6.35□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 CHRNDQ07001 517 aa6.35□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 GPS2Q13227 327 aa6.35□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 CYP26C1Q6V0L0 522 aa6.35□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 MON1BQ7L1V2 547 aa6.35□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 PRSS45Q7RTY3 260 aa6.35□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa6.35□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.35□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 HERVK_113Q902F9 699 aa6.35□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 OTULINQ96BN8 352 aa6.35□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 ZPBPQ9BS86 351 aa6.35□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 SELENONQ9NZV5 590 aa6.35□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 HDAC6Q9UBN7 1215 aa6.35□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 RAI2Q9Y5P3 530 aa6.35□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa6.34□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa6.34□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 LACTBL1A8MY62 500 aa6.34□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 RGS14O43566 566 aa6.34□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 BLKP51451 505 aa6.34□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 TLE2Q04725 743 aa6.34□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 NAA25Q14CX7 972 aa6.34□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 ATG16L1Q676U5 607 aa6.34□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.34□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 RAB40AQ8WXH6 277 aa6.34□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 TMEM18Q96B42 140 aa6.34□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 CXorf56Q9H5V9 222 aa6.34□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 INSL5Q9Y5Q6 135 aa6.34□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa6.34□□□□□ -1.39
USP34-216ENST00000487547 ARHGAP10A1A4S6 786 aa6.33□□□□□ -1.4
USP34-216ENST00000487547 FAM90A7PA6NKC0 464 aa6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.6 ms