RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 KITP10721 976 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 ANPEPP15144 967 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 NFKB1P19838 968 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 CPOXP36551 454 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 SCNN1GP51170 649 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 RENBPP51606 427 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 NDST2P52849 883 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 ARHGAP8P85298 464 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 KDSRQ06136 332 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 TNK2Q07912 1038 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 TUSC3Q13454 348 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 ITGA9Q13797 1035 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 RCN2Q14257 317 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 MAPRE2Q15555 327 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 BTBD8Q5XKL5 378 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 ZFP1Q6P2D0 407 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 NECAB2Q7Z6G3 386 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 SERINC5Q86VE9 423 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 TREML1Q86YW5 311 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 ATPAF2Q8N5M1 289 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 ZMIZ2Q8NF64 920 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 STYXQ8WUJ0 223 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 DPF3Q92784 378 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 PPP2R3CQ969Q6 453 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 VPS39Q96JC1 886 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 SERPINB11Q96P15 392 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 ASB2Q96Q27 587 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 SORT1Q99523 831 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 TBL1YQ9BQ87 522 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 LPIN3Q9BQK8 851 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 TRMOQ9BU70 441 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 FAM192AQ9GZU8 254 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 CXCL16Q9H2A7 254 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 SMOC2Q9H3U7 446 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 FBXO44Q9H4M3 255 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 GLOD4Q9HC38 313 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 NMRK1Q9NWW6 199 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 NDUFA13Q9P0J0 144 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 ARMCX1Q9P291 453 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 SLC7A8Q9UHI5 535 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 A0A088AWK7 358 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 HEATR9A2RTY3 570 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 MYBPHLA2RUH7 354 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 H0Y3Z8 333 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 MATN2O00339 956 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 IRAK2O43187 625 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 ITM2AO43736 263 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 LRIG2O94898 1065 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 EOMESO95936 686 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 COL6A1P12109 1028 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 COX4I1P13073 169 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 STMN1P16949 149 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 GLDCP23378 1020 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 CD68P34810 354 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 CLCNKBP51801 687 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 SLC12A2P55011 1212 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 RAB10P61026 200 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 DSG1Q02413 1049 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 SMARCB1Q12824 385 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 USP10Q14694 798 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 PSMD5Q16401 504 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 FAM83EQ2M2I3 478 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 SEL1L3Q68CR1 1132 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 C16orf46Q6P387 395 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 KLC3Q6P597 504 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 RFWD3Q6PCD5 774 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 RAPH1Q70E73 1250 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 TTC7BQ86TV6 843 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 MON1AQ86VX9 555 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 SLC22A9Q8IVM8 553 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 MFN1Q8IWA4 741 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 TMEM130Q8N3G9 435 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 FBXW8Q8N3Y1 598 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 CNTD1Q8N815 330 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 GSTCDQ8NEC7 633 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-208ENST00000464611 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
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