RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440016.6

HOXD-AS2-202, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 999 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PCDH19Q8TAB3 1148 aa27.61■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa27.61■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RAPGEF5Q92565 580 aa27.61■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 HEPHQ9BQS7 1158 aa27.61■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GOLPH3Q9H4A6 298 aa27.61■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SMOC1Q9H4F8 434 aa27.61■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RNF103O00237 685 aa27.6■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PLK4O00444 970 aa27.6■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PJA2O43164 708 aa27.6■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SPOPO43791 374 aa27.6■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SERPINB6P35237 376 aa27.6■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CYTH1Q15438 398 aa27.6■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ARSIQ5FYB1 569 aa27.6■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LRRC38Q5VT99 294 aa27.6■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SYT12Q8IV01 421 aa27.6■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RHOT1Q8IXI2 618 aa27.6■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FAM131CQ96AQ9 280 aa27.6■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FAF2Q96CS3 445 aa27.6■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LACRTQ9GZZ8 138 aa27.6■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PCED1AQ9H1Q7 454 aa27.6■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SP110Q9HB58 689 aa27.6■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 VPS45Q9NRW7 570 aa27.6■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TMEM74BQ9NUR3 256 aa27.6■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PILRBQ9UKJ0 227 aa27.6■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ALG6Q9Y672 507 aa27.6■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SHROOM3Q8TF72 1996 aa27.59■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 METTL12A8MUP2 240 aa27.59■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MEI4A8MW99 385 aa27.59■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LEFTY1O75610 366 aa27.59■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZNF806P0C7X5 589 aa27.59■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TNNT1P13805 278 aa27.59■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RHOAP61586 193 aa27.59■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IL10RBQ08334 325 aa27.59■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CNTN1Q12860 1018 aa27.59■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DCAF12L1Q5VU92 463 aa27.59■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa27.59■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KIAA1328Q86T90 577 aa27.59■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ARRDC3Q96B67 414 aa27.59■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DESI2Q9BSY9 194 aa27.59■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa27.59■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DUSP10Q9Y6W6 482 aa27.59■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GON4LQ3T8J9 2241 aa27.59■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LRRD1A4D1F6 860 aa27.58■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa27.58■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BTNL10A8MVZ5 291 aa27.58■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DPP6P42658 865 aa27.58■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SYCP2LQ5T4T6 812 aa27.58■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C11orf63Q6NUN7 778 aa27.58■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PRR23CQ6ZRP0 262 aa27.58■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RGL4Q8IZJ4 473 aa27.58■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 OR6K2Q8NGY2 324 aa27.58■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TPCN2Q8NHX9 752 aa27.58■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LHX3Q9UBR4 397 aa27.58■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MFSD11O43934 449 aa27.57■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IGSF6O95976 241 aa27.57■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRT1P04264 644 aa27.57■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GKP32189 559 aa27.57■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ADPRHP54922 357 aa27.57■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 WDR45BQ5MNZ6 344 aa27.57■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 AGBL4Q5VU57 503 aa27.57■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PQLC3Q8N755 202 aa27.57■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 OR14C36Q8NHC7 312 aa27.57■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 VOPP1Q96AW1 172 aa27.57■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa27.57■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FAM47DPA6NHR8 397 aa27.56■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PATE3B3GLJ2 98 aa27.56■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SLC7A4O43246 635 aa27.56■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MAOBP27338 520 aa27.56■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MYLK3Q32MK0 819 aa27.56■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TCEAL6Q6IPX3 200 aa27.56■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NCEH1Q6PIU2 408 aa27.56■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DAAM2Q86T65 1068 aa27.56■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 OR2T34Q8NGX1 318 aa27.56■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DNASE2BQ8WZ79 361 aa27.56■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TCEAL3Q969E4 200 aa27.56■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 EXOC2Q96KP1 924 aa27.56■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RNF157Q96PX1 679 aa27.56■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DYRK4Q9NR20 520 aa27.56■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PI4KAP42356 2102 aa27.55■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LRRC72A6NJI9 287 aa27.55■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZNF487B1APH4 448 aa27.55■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRIT1O00522 736 aa27.55■■■□□ 2
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PSTPIP1O43586 416 aa27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms