RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416605.6

HACE1-204, Transcript of HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HACE1, Length 4,729 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1-204ENST00000416605 FBXO30Q8TB52 745 aa17.24■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 CSPG4P5Q96PW8 444 aa17.24■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 ULBP1Q9BZM6 244 aa17.24■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 OR12D3Q9UGF7 316 aa17.24■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 ATP6V1G1O75348 118 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 HGFP14210 728 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 CLCN5P51795 746 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 TCEAL1Q15170 157 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 SPANXN2Q5MJ10 180 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 TTC23LQ6PF05 361 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 EGFL6Q8IUX8 553 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 ADHFE1Q8IWW8 467 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 BBS7Q8IWZ6 715 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 TFAP2BQ92481 460 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 OSMRQ99650 979 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 TXLNGYQ9BZA5 131 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 VTA1Q9NP79 307 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 CNGB3Q9NQW8 809 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 CRLS1Q9UJA2 301 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 DOLKQ9UPQ8 538 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 TYROBPO43914 113 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 KATNA1O75449 491 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 LTFP02788 710 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 TLDC1Q6P9B6 456 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 TRIM74Q86UV6 250 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 TRIM73Q86UV7 250 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 STX19Q8N4C7 294 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 ACSS2Q9NR19 701 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 H3BRB1 525 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 TM4SF1P30408 202 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 ASRGL1Q7L266 308 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 COX4I2Q96KJ9 171 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 AAASQ9NRG9 546 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 C3orf18Q9UK00 162 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 AKAP5P24588 427 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 NUMBP49757 651 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 ENPEPQ07075 957 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 FSTL1Q12841 308 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 DLG1Q12959 904 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 CBX3Q13185 183 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 PGS1Q32NB8 556 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 NADK2Q4G0N4 442 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 FAM45BPQ6NSW5 357 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 CCDC80Q76M96 950 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 PIGZQ86VD9 579 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 ANKRD52Q8NB46 1076 aa17.23■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 KCNU1A8MYU2 1149 aa17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 MAPK1P28482 360 aa17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 PRIM2P49643 509 aa17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 TUBP50607 506 aa17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 TJAP1Q5JTD0 557 aa17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 SEC24AO95486 1093 aa17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 CCNG1P51959 295 aa17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 LIMK2P53671 638 aa17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 SPESP1Q6UW49 350 aa17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 OR2T34Q8NGX1 318 aa17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 OR2T3Q8NH03 318 aa17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 TBCDQ9BTW9 1192 aa17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 HGH1Q9BTY7 390 aa17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 SPATC1LQ9H0A9 340 aa17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 CXorf21Q9HAI6 301 aa17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 UGT1A9O60656 530 aa17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 TCF4P15884 667 aa17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 CERCAMQ5T4B2 595 aa17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 RHBDF2Q6PJF5 856 aa17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 AHI1Q8N157 1196 aa17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 OTULINQ96BN8 352 aa17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 CLPBQ9H078 707 aa17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 UNC93B1Q9H1C4 597 aa17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 TMEM245Q9H330 911 aa17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 UGT1A7Q9HAW7 530 aa17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 UGT1A10Q9HAW8 530 aa17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 UGT1A8Q9HAW9 530 aa17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 YDJCA8MPS7 323 aa17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 SERPINF2P08697 491 aa17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 ZNF846Q147U1 533 aa17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 HOMEZQ8IX15 550 aa17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 SYTL1Q8IYJ3 562 aa17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 MTERF3Q96E29 417 aa17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 TRAF6Q9Y4K3 522 aa17.22■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa17.21■□□□□ 0.35
HACE1-204ENST00000416605 BTN3A1O00481 513 aa17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms