RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390930.1

SNORD17-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 17, humanhuman

BASIC

Gene SNORD17, Length 237 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD17-201ENST00000390930 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ST8SIA6P61647 398 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PPP2CBP62714 309 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PPP2CAP67775 309 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 IRX4P78413 519 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CCZ1BP86790 482 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CREB5Q02930 508 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 GBE1Q04446 702 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ZBTB16Q05516 673 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SLC20A2Q08357 652 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SLC10A7Q0GE19 358 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 GALNT2Q10471 571 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 FGL2Q14314 439 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PTPRRQ15256 657 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 LLGL1Q15334 1064 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CSRP2Q16527 193 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 MYLK3Q32MK0 819 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PARP15Q460N3 678 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CARD16Q5EG05 197 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SPDYCQ5MJ68 293 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 AGBL4Q5VU57 503 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 RETSATQ6NUM9 610 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 AADACL2Q6P093 401 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SLC23A3Q6PIS1 610 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 NCEH1Q6PIU2 408 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 LAYNQ6UX15 382 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 MFSD7Q6UXD7 560 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 NPNTQ6UXI9 565 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SLC36A4Q6YBV0 504 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PRR23CQ6ZRP0 262 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 USP30Q70CQ3 517 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 LPCAT2Q7L5N7 544 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 RHOT2Q8IXI1 618 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PLPP6Q8IY26 295 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TEX26Q8N6G2 289 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PLD5Q8N7P1 536 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 LRRC57Q8N9N7 239 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TMIEQ8NEW7 156 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CADM4Q8NFZ8 388 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 OR2I1PQ8NGU4 316 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TPCN2Q8NHX9 752 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 OR8D1Q8WZ84 308 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PIGKQ92643 395 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 BIRC7Q96CA5 298 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 RMDN1Q96DB5 314 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 EXOC2Q96KP1 924 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SPACA7Q96KW9 195 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 RNF157Q96PX1 679 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 NCAPGQ9BPX3 1015 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CEP44Q9C0F1 390 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 FBRSQ9HAH7 460 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CAPN10Q9HC96 672 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 FBXL12Q9NXK8 326 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 IMPACTQ9P2X3 320 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 NCDNQ9UBB6 729 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 GGT7Q9UJ14 662 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ITM2BQ9Y287 266 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ALG6Q9Y672 507 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ASPMQ8IZT6 3477 aa3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SPTBN2O15020 2390 aa3.52□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 A0A1W2PPC4 97 aa3.52□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 A0A1W2PR77 199 aa3.52□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 LNP1A1A4G5 178 aa3.52□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 FAM47DPA6NHR8 397 aa3.52□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 ARHGAP42A6NI28 874 aa3.52□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 BTNL10A8MVZ5 291 aa3.52□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa3.52□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 DFFAO00273 331 aa3.52□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 KRIT1O00522 736 aa3.52□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 KCNK3O14649 394 aa3.52□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 AREL1O15033 823 aa3.52□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 ALOX15BO15296 676 aa3.52□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 RAD51BO15315 384 aa3.52□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
SNORD17-201ENST00000390930 MAP3K13O43283 966 aa3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms