RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373184.5

PTPRT-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,483 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-202ENST00000373184 LIN54Q6MZP7 749 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-202ENST00000373184 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-202ENST00000373184 POTEHQ6S545 545 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-202ENST00000373184 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-202ENST00000373184 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-202ENST00000373184 SAMD7Q7Z3H4 446 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-202ENST00000373184 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-202ENST00000373184 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-202ENST00000373184 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-202ENST00000373184 TCP10LQ8TDR4 215 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-202ENST00000373184 FNIP1Q8TF40 1166 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRT-202ENST00000373184 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-202ENST00000373184 ARHGEF3Q9NR81 526 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-202ENST00000373184 EMC3Q9P0I2 261 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-202ENST00000373184 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-202ENST00000373184 NUDT17P0C025 328 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-202ENST00000373184 ERCC2P18074 760 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRT-202ENST00000373184 LGALS3BPQ08380 585 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRT-202ENST00000373184 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-202ENST00000373184 MYLPFQ96A32 169 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-202ENST00000373184 ZNF607Q96SK3 696 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-202ENST00000373184 TRPS1Q9UHF7 1281 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRT-202ENST00000373184 H3BNX3 289 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-202ENST00000373184 HIST1H2ABP04908 130 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-202ENST00000373184 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-202ENST00000373184 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-202ENST00000373184 SLC12A3P55017 1021 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-202ENST00000373184 BTKQ06187 659 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-202ENST00000373184 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-202ENST00000373184 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-202ENST00000373184 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-202ENST00000373184 RIOX2Q8IUF8 465 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-202ENST00000373184 HIST1H2ACQ93077 130 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-202ENST00000373184 ACOX2Q99424 681 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRT-202ENST00000373184 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-202ENST00000373184 LGALS2P05162 132 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRT-202ENST00000373184 BRMS1LQ5PSV4 323 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-202ENST00000373184 NEPROQ6NW34 567 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-202ENST00000373184 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-202ENST00000373184 RASSF5Q8WWW0 418 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-202ENST00000373184 MKL1Q969V6 931 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRT-202ENST00000373184 H3BNH8 94 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRT-202ENST00000373184 S100ZQ8WXG8 99 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRT-202ENST00000373184 MST1RQ04912 1400 aa6.09□□□□□ -1.44
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PTPRT-202ENST00000373184 ARP10275 920 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRT-202ENST00000373184 FEN1P39748 380 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.44
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PTPRT-202ENST00000373184 ATP6V1HQ9UI12 483 aa6.09□□□□□ -1.44
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PTPRT-202ENST00000373184 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRT-202ENST00000373184 IRAK3Q9Y616 596 aa6.09□□□□□ -1.44
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PTPRT-202ENST00000373184 USP41Q3LFD5 358 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRT-202ENST00000373184 NELL1Q92832 810 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRT-202ENST00000373184 CYLDQ9NQC7 956 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRT-202ENST00000373184 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.44
PTPRT-202ENST00000373184 OR6C75A6NL08 312 aa6.08□□□□□ -1.44
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PTPRT-202ENST00000373184 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRT-202ENST00000373184 DPYSL3Q14195 570 aa6.08□□□□□ -1.44
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