RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356924.8

ABCD4-201, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ABCD4, Length 3,003 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-201ENST00000356924 GAREM2Q75VX8 874 aa11.3□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 ARNTL2Q8WYA1 636 aa11.3□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa11.3□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 GLOD4Q9HC38 313 aa11.3□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 CASS4Q9NQ75 786 aa11.3□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 TBK1Q9UHD2 729 aa11.3□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 SLC24A2Q9UI40 661 aa11.3□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa11.3□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 C5orf67F2Z3F1 127 aa11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 GREM1O60565 184 aa11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 PIAS1O75925 651 aa11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 CREB1P16220 341 aa11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 CALB2P22676 271 aa11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 MGAT1P26572 445 aa11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 ERFP50548 548 aa11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 ZXDBP98169 803 aa11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 CYP4F8P98187 520 aa11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 CAMK1Q14012 370 aa11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 TXNDC8Q6A555 127 aa11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 CCDC149Q6ZUS6 474 aa11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 FAM47EQ6ZV65 393 aa11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 ASRGL1Q7L266 308 aa11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 OR52K1Q8NGK4 314 aa11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 FCRL5Q96RD9 977 aa11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 TRPC7Q9HCX4 862 aa11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 SPAG6O75602 509 aa11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 LRG1P02750 347 aa11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 GSTA2P09210 222 aa11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 CLCN4P51793 760 aa11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 TMED2Q15363 201 aa11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 KLHL38Q2WGJ6 581 aa11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 STEAP4Q687X5 459 aa11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 DCAKDQ8WVC6 231 aa11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 PPCSQ9HAB8 311 aa11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP11.29□□□□□ -0.62e-6■■■□□ 16.5
ABCD4-201ENST00000356924 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa11.29□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 USP12O75317 370 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 GNAZP19086 355 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 GABRR2P28476 465 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 ACVRL1P37023 503 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 CRADDP78560 199 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 SERINC3Q13530 473 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 ADGRD1Q6QNK2 874 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 TAOK1Q7L7X3 1001 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 OR52K2Q8NGK3 314 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 SPATA22Q8NHS9 363 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 SLC22A17Q8WUG5 538 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 TLR9Q9NR96 1032 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 SYBUQ9NX95 663 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 SMPD4Q9NXE4 827 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 UBP1Q9NZI7 540 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 LMCD1Q9NZU5 365 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 STOML2Q9UJZ1 356 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 RWDD3Q9Y3V2 267 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 SDR42E2A6NKP2 422 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 GRXCR1A8MXD5 290 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 GRM6O15303 877 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 RAMP2O60895 175 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 GLUD1P00367 558 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 PRKCHP24723 683 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 OR1E1P30953 314 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 IRS1P35568 1242 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 RPS24P62847 133 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 PARP15Q460N3 678 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 CMPK2Q5EBM0 449 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 C9orf50Q5SZB4 431 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 TEX26Q8N6G2 289 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 DTNBP1Q96EV8 351 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 PAFAH2Q99487 392 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 RETREG1Q9H6L5 497 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 SMYD2Q9NRG4 433 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 TRIM33Q9UPN9 1127 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 HELZP42694 1942 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 ATP5DP30049 168 aa11.27□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 STX2P32856 288 aa11.27□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 CDH4P55283 916 aa11.27□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 UBE3AQ05086 875 aa11.27□□□□□ -0.6
ABCD4-201ENST00000356924 TNK2Q07912 1038 aa11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms