RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309909.9

FBXW8-201, Transcript of F-box and WD repeat domain containing 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FBXW8, Length 2,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW8-201ENST00000309909 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 TMEM39AQ9NV64 488 aa20.38■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 MTRRQ9UBK8 725 aa20.38■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 HEY2Q9UBP5 337 aa20.38■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 SLC39A10Q9ULF5 831 aa20.38■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 WASH4PA8MWX3 477 aa20.37■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 COCHO43405 550 aa20.37■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 BUD23O43709 281 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 EFEMP2O95967 443 aa20.37■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 T-ENOLP0DO92 83 aa20.37■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 ACRP10323 421 aa20.37■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 SERPINB3P29508 390 aa20.37■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 ALDH3A1P30838 453 aa20.37■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 PKN3Q6P5Z2 889 aa20.37■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 RNF135Q8IUD6 432 aa20.37■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 CNPY4Q8N129 248 aa20.37■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa20.37■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 TRIM55Q9BYV6 548 aa20.37■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 SMPD4Q9NXE4 827 aa20.37■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 ZNF840PA6NDX5 716 aa20.37■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 PLIN3O60664 434 aa20.37■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 RAMP2O60895 175 aa20.37■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 MYL2P10916 166 aa20.37■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 TACR2P21452 398 aa20.37■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 CNTFP26441 200 aa20.37■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 LIMK2P53671 638 aa20.37■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 PTPRCAPQ14761 206 aa20.37■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 GRTP1Q5TC63 336 aa20.37■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 LINC00523Q86TU6 105 aa20.37■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 MFSD6LQ8IWD5 586 aa20.37■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 OR7D4Q8NG98 312 aa20.37■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 VPS39Q96JC1 886 aa20.37■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 KCTD3Q9Y597 815 aa20.37■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 TSPAN3O60637 253 aa20.36■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 PIRTP0C851 137 aa20.36■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 CSF2RAP15509 400 aa20.36■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 HTR7P34969 479 aa20.36■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 ZNF789Q5FWF6 425 aa20.36■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 PCID2Q5JVF3 399 aa20.36■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 BHMTQ93088 406 aa20.36■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 A0A096LPK6 155 aa20.36■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 DRGXA6NNA5 263 aa20.36■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 A8MUI8 341 aa20.36■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 PSEN1P49768 467 aa20.36■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 RENBPP51606 427 aa20.36■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 NDST2P52849 883 aa20.36■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 PLD1Q13393 1074 aa20.36■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 PCLAFQ15004 111 aa20.36■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 KDELC1Q6UW63 502 aa20.36■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa20.36■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 KLHL29Q96CT2 875 aa20.36■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 EXOC2Q96KP1 924 aa20.36■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 SLC22A12Q96S37 553 aa20.36■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 MKS1Q9NXB0 559 aa20.36■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 ARMCX1Q9P291 453 aa20.36■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 STK38LQ9Y2H1 464 aa20.36■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 COL4A6Q14031 1691 aa20.35■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 MAGEB16A2A368 324 aa20.35■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 C2P06681 752 aa20.35■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 KRT16P08779 473 aa20.35■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 SPRP35270 261 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 GLRBP48167 497 aa20.35■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 ARFIP2P53365 341 aa20.35■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 GEMP55040 296 aa20.35■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 OCRLQ01968 901 aa20.35■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 SETDB1Q15047 1291 aa20.35■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 CYB5D1Q6P9G0 228 aa20.35■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 NSMCE3Q96MG7 304 aa20.35■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 MCMBPQ9BTE3 642 aa20.35■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 TBX21Q9UL17 535 aa20.35■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 SERINC3Q13530 473 aa20.35■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 MBLAC2Q68D91 279 aa20.35■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 C16orf59Q7L2K0 433 aa20.35■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 ZNF461Q8TAF7 563 aa20.35■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 SMIM14Q96QK8 99 aa20.35■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 SLC25A51Q9H1U9 297 aa20.35■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 DNMT3LQ9UJW3 386 aa20.35■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 PROCP04070 461 aa20.34■□□□□ 0.85
FBXW8-201ENST00000309909 GSTA1P08263 222 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms