RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253099.10

MRPL4-201, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MRPL4, Length 1,455 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL4-201ENST00000253099 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
MRPL4-201ENST00000253099 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
MRPL4-201ENST00000253099 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa25.4■■□□□ 1.66
MRPL4-201ENST00000253099 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 MUSKO15146 869 aa25.39■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 JCHAINP01591 159 aa25.39■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 RBL1P28749 1068 aa25.39■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 AVPR2P30518 371 aa25.39■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 ZBTB17Q13105 803 aa25.39■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 ZNF235Q14590 738 aa25.39■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 MAMSTRQ6ZN01 415 aa25.39■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 ZNF592Q92610 1267 aa25.39■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 EXOC2Q96KP1 924 aa25.39■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 PSKH2Q96QS6 385 aa25.39■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 PRR33A8MZF0 331 aa25.38■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 LIASO43766 372 aa25.38■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 CXCL12P48061 93 aa25.38■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 DGKEP52429 567 aa25.38■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 SNX1Q13596 522 aa25.38■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 CARD16Q5EG05 197 aa25.38■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa25.38■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 STK40Q8N2I9 435 aa25.38■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 PGBD5Q8N414 524 aa25.38■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 PRELID2Q8N945 189 aa25.38■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 HTR3CQ8WXA8 447 aa25.38■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 IL12RB2Q99665 862 aa25.38■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 AP1M1Q9BXS5 423 aa25.38■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 CEP41Q9BYV8 373 aa25.38■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 NT5MQ9NPB1 228 aa25.38■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 GSRP00390 522 aa25.37■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 RGRP47804 291 aa25.37■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 WASHC5Q12768 1159 aa25.37■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 CCNG2Q16589 344 aa25.37■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 TMEM31Q5JXX7 168 aa25.37■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 PLPP6Q8IY26 295 aa25.37■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 BBS5Q8N3I7 341 aa25.37■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 DTWD2Q8NBA8 298 aa25.37■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 CHST14Q8NCH0 376 aa25.37■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 OR2AP1Q8NGE2 309 aa25.37■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 FAM129BQ96TA1 746 aa25.37■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 USP29Q9HBJ7 922 aa25.37■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa25.36■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 MTSS1O43312 755 aa25.36■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 PTPN3P26045 913 aa25.36■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 CCR3P51677 355 aa25.36■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 COPAP53621 1224 aa25.36■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 CNTD1Q8N815 330 aa25.36■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 OR6K2Q8NGY2 324 aa25.36■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 CCDC114Q96M63 670 aa25.36■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 HHIPQ96QV1 700 aa25.36■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa25.36■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 KRIT1O00522 736 aa25.35■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 DLL1O00548 723 aa25.35■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 KCNN4O15554 427 aa25.35■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 GJB3O75712 270 aa25.35■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 NEBLO76041 1014 aa25.35■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 HLA-DQB2P05538 268 aa25.35■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 MAXP61244 160 aa25.35■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP25.35■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 OASLQ15646 514 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 TEX44Q53QW1 395 aa25.35■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 OR2T3Q8NH03 318 aa25.35■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa25.35■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 AGAP3Q96P47 875 aa25.35■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 MGME1Q9BQP7 344 aa25.35■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 TMEM121Q9BTD3 319 aa25.35■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 RNF103O00237 685 aa25.34■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 IGSF6O95976 241 aa25.34■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 GKP32189 559 aa25.34■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 NRLP54845 237 aa25.34■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 MYLK3Q32MK0 819 aa25.34■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 C1orf210Q8IVY1 113 aa25.34■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 TSTD1Q8NFU3 115 aa25.34■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 OR8D1Q8WZ84 308 aa25.34■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 SLC6A17Q9H1V8 727 aa25.34■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 HOMER3Q9NSC5 361 aa25.34■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 AMACRQ9UHK6 382 aa25.34■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
MRPL4-201ENST00000253099 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms