RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000228515.5

CSRNP2-201, Transcript of cysteine and serine rich nuclear protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSRNP2, Length 4,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP2-201ENST00000228515 LPCAT4Q643R3 524 aa14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 TRIM48Q8IWZ4 208 aa14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 C19orf18Q8NEA5 215 aa14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 TEKT5Q96M29 485 aa14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 MFSD14AQ96MC6 490 aa14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 CAMKK2Q96RR4 588 aa14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 ADAM2Q99965 735 aa14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 SPAG4Q9NPE6 437 aa14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 ADGRB2O60241 1585 aa14.91□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 TCF3P15923 654 aa14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 RAB14P61106 215 aa14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 RAP1GAP2Q684P5 730 aa14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 CACUL1Q86Y37 369 aa14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 SEMA3CQ99985 751 aa14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 PCDH18Q9HCL0 1135 aa14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 CATSPERZQ9NTU4 200 aa14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 KLHL3Q9UH77 587 aa14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 DARSP14868 501 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 PIK3R1P27986 724 aa14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 EPHX2P34913 555 aa14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 ACVR2BQ13705 512 aa14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 MFSD5Q6N075 450 aa14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 UTS2BQ765I0 119 aa14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 ASB2Q96Q27 587 aa14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 TM6SF2Q9BZW4 377 aa14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 AP4B1Q9Y6B7 739 aa14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 LGR5O75473 907 aa14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 GRK3P35626 688 aa14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 TALDO1P37837 337 aa14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 SLC7A2P52569 658 aa14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 GCNT7Q6ZNI0 430 aa14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 ACTRT2Q8TDY3 377 aa14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 FNIP1Q8TF40 1166 aa14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 NDEL1Q9GZM8 345 aa14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 BPGMP07738 259 aa14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 PPP2R1BP30154 601 aa14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 GPR15P49685 360 aa14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 NR1H2P55055 460 aa14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 RAB10P61026 200 aa14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 IRF8Q02556 426 aa14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 MAPKAPK3Q16644 382 aa14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 SVOPQ8N4V2 548 aa14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 SERAC1Q96JX3 654 aa14.9□□□□□ -0.02
CSRNP2-201ENST00000228515 A0A087X1B8 175 aa14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 FAM25AB3EWG3 89 aa14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 FAM25CB3EWG5 89 aa14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 FAM25GB3EWG6 89 aa14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 IRF6O14896 467 aa14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 LRCH4O75427 683 aa14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 ANXA6P08133 673 aa14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 GABRB2P47870 512 aa14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 FOLH1Q04609 750 aa14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 BNIP1Q12981 228 aa14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 CRY1Q16526 586 aa14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 PERM1Q5SV97 790 aa14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 CERCAMQ5T4B2 595 aa14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 ZNF618Q5T7W0 954 aa14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 HPS6Q86YV9 775 aa14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 SYT12Q8IV01 421 aa14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 C1orf50Q9BV19 199 aa14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 STARD7Q9NQZ5 370 aa14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 ABCC13Q9NSE7 274 aa14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 CAPN8A6NHC0 703 aa14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 RGS14O43566 566 aa14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 ALDH1A2O94788 518 aa14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 TSHRP16473 764 aa14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 TYMPP19971 482 aa14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 CYP2A7P20853 494 aa14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 EPHB3P54753 998 aa14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 BCL2L1Q07817 233 aa14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 ARMC6Q6NXE6 501 aa14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 CCDC149Q6ZUS6 474 aa14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 OOSP2Q86WS3 158 aa14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 HELQQ8TDG4 1101 aa14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 HDAC10Q969S8 669 aa14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 REEP1Q9H902 201 aa14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 RAD18Q9NS91 495 aa14.89□□□□□ -0.03
CSRNP2-201ENST00000228515 TRIM38O00635 465 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms