RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227638.7

PANX1-201, Transcript of pannexin 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PANX1, Length 2,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1-201ENST00000227638 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa18.4■□□□□ 0.54
PANX1-201ENST00000227638 ATP6AP2O75787 350 aa18.4■□□□□ 0.54
PANX1-201ENST00000227638 CELF2O95319 508 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
PANX1-201ENST00000227638 F2P00734 622 aa18.4■□□□□ 0.54
PANX1-201ENST00000227638 ITGB1P05556 798 aa18.4■□□□□ 0.54
PANX1-201ENST00000227638 VCLP18206 1134 aa18.4■□□□□ 0.54
PANX1-201ENST00000227638 LAMB3Q13751 1172 aa18.4■□□□□ 0.54
PANX1-201ENST00000227638 CEACAM7Q14002 265 aa18.4■□□□□ 0.54
PANX1-201ENST00000227638 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
PANX1-201ENST00000227638 MMEL1Q495T6 779 aa18.4■□□□□ 0.54
PANX1-201ENST00000227638 TSTD2Q5T7W7 516 aa18.4■□□□□ 0.54
PANX1-201ENST00000227638 IQSEC1Q6DN90 963 aa18.4■□□□□ 0.54
PANX1-201ENST00000227638 GK5Q6ZS86 529 aa18.4■□□□□ 0.54
PANX1-201ENST00000227638 BNIPLQ7Z465 357 aa18.4■□□□□ 0.54
PANX1-201ENST00000227638 SATL1Q86VE3 508 aa18.4■□□□□ 0.54
PANX1-201ENST00000227638 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa18.4■□□□□ 0.54
PANX1-201ENST00000227638 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa18.4■□□□□ 0.54
PANX1-201ENST00000227638 ARNTP27540 789 aa18.39■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 NME5P56597 212 aa18.39■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 TIGD5Q53EQ6 642 aa18.39■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 APBB2Q92870 758 aa18.39■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 PCDHAC1Q9H158 963 aa18.39■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 WARSP23381 471 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 TAS2R39P59534 338 aa18.39■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 PTPRCAPQ14761 206 aa18.39■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 PITRM1Q5JRX3 1037 aa18.39■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 LRRTM3Q86VH5 581 aa18.39■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 FAM110BQ8TC76 370 aa18.39■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 GPR152Q8TDT2 470 aa18.39■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 PHF21BQ96EK2 531 aa18.39■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 TEKT5Q96M29 485 aa18.39■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 FERMT1Q9BQL6 677 aa18.39■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 KLHL4Q9C0H6 718 aa18.39■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa18.39■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 GTSE1Q9NYZ3 720 aa18.39■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 GIMAP2Q9UG22 337 aa18.39■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 APPL1Q9UKG1 709 aa18.39■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 CDY2AQ9Y6F7 541 aa18.39■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 CDY1Q9Y6F8 540 aa18.39■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 MATN2O00339 956 aa18.38■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 FGFR3P22607 806 aa18.38■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 GLDCP23378 1020 aa18.38■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 MAGEA12P43365 314 aa18.38■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 TLR1Q15399 786 aa18.38■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 GPR162Q16538 588 aa18.38■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 CCDC153Q494R4 210 aa18.38■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 CNSTQ6PJW8 725 aa18.38■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa18.38■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 LILRA2Q8N149 483 aa18.38■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 MYLPFQ96A32 169 aa18.38■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 SLC39A3Q9BRY0 314 aa18.38■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 OR51F1A6NGY5 319 aa18.38■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 RRN3P2A6NIE6 340 aa18.38■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 PEX1O43933 1283 aa18.38■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 CSPG5O95196 566 aa18.38■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 KCNE1P15382 129 aa18.38■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 MTTPP55157 894 aa18.38■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 RALGDSQ12967 914 aa18.38■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 CSHL1Q14406 222 aa18.38■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 SEL1L3Q68CR1 1132 aa18.38■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 ELMO2Q96JJ3 720 aa18.38■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 KLHL5Q96PQ7 755 aa18.38■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 UBAP1Q9NZ09 502 aa18.38■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 DNAJA2O60884 412 aa18.37■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 ATP6V1B1P15313 513 aa18.37■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 GSTT1P30711 240 aa18.37■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 SLC1A2P43004 574 aa18.37■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 PSEN2P49810 448 aa18.37■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 TBCCQ15814 346 aa18.37■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 INSCQ1MX18 579 aa18.37■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 SH2D4BQ5SQS7 431 aa18.37■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 STXBP5Q5T5C0 1151 aa18.37■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 ZNF470Q6ECI4 717 aa18.37■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 ANKRD23Q86SG2 305 aa18.37■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 EXT2Q93063 718 aa18.37■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 NAT9Q9BTE0 207 aa18.37■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 TRIM8Q9BZR9 551 aa18.37■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 TRPV6Q9H1D0 765 aa18.37■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 GPAMQ9HCL2 828 aa18.37■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 CLIC5Q9NZA1 410 aa18.37■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 KCNU1A8MYU2 1149 aa18.37■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 HHLA1C9JL84 531 aa18.37■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 GABRDO14764 452 aa18.37■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 FKBP6O75344 327 aa18.37■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 RPL14P50914 215 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 FOLH1Q04609 750 aa18.37■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 FAM110CQ1W6H9 321 aa18.37■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 CNPY1Q3B7I2 92 aa18.37■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 SPRYD7Q5W111 196 aa18.37■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 IYDQ6PHW0 289 aa18.37■□□□□ 0.53
PANX1-201ENST00000227638 C14orf80Q86SX3 495 aa18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms