RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639482.1

SPIN3-222, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 3

Gene SPIN3, Length 3,719 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-222	ENST00000639482	MCU	Q8NE86	351 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	SPATA13	Q96N96	652 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	VTA1	Q9NP79	307 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	DPP3	Q9NY33	737 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	STK39	Q9UEW8	545 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	SCN1A	P35498	2009 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482		A0A0J9YVX5	310 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	PGK1	P00558	417 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	CYP2C9	P11712	490 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	CDK4	P11802	303 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	PGAM1	P18669	254 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	ME2	P23368	584 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	ABCD1	P33897	745 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	SULT1E1	P49888	294 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	C16orf89	Q6UX73	402 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	URGCP	Q8TCY9	931 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	KPNA7	A9QM74	516 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF195	O14628	629 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	AKAP10	O43572	662 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	UGT1A6	P19224	532 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	TFEB	P19484	476 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	CTBP1	Q13363	440 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	MPP3	Q13368	585 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	GEN1	Q17RS7	908 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF786	Q8N393	782 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	RTKN	Q9BST9	563 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	BFAR	Q9NZS9	450 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	TMCO1	Q9UM00	188 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	PLXNB2	O15031	1838 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	B4GALT4	O60513	344 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	VAPB	O95292	243 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	PFKM	P08237	780 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	CCR3	P51677	355 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	PRPSAP1	Q14558	356 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	EPGN	Q6UW88	154 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	IFNE	Q86WN2	208 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF567	Q8N184	647 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	FAM110B	Q8TC76	370 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	NCSTN	Q92542	709 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	CDYL	Q9Y232	598 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	NME7	Q9Y5B8	376 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	TIPRL	O75663	272 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	ENDOD1	O94919	500 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	MT-ND1	P03886	318 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	DBN1	Q16643	649 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	ZFP42	Q96MM3	310 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	BTBD9	Q96Q07	612 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF670	Q9BS34	389 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	BCO2	Q9BYV7	579 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	CHST12	Q9NRB3	414 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF839	A8K0R7	811 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	STRN	O43815	780 aa		10.2	□□□□□ -0.78

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