RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 PCDH18Q9HCL0 1135 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 ETNK2Q9NVF9 386 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 FBXL12Q9NXK8 326 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 DONSONQ9NYP3 566 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 SARDHQ9UL12 918 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 HS3ST2Q9Y278 367 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 DUSP10Q9Y6W6 482 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 SPAG17Q6Q759 2223 aa6.94□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 DOCK9Q9BZ29 2069 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 RNF103O00237 685 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 KRIT1O00522 736 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 SPOPO43791 374 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 MTA2O94776 668 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 EPN2O95208 641 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 C5AR1P21730 350 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 COMTP21964 271 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 FECHP22830 423 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 CHRNA3P32297 505 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 ARSEP51690 589 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 METAP1P53582 386 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 ZBTB16Q05516 673 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF33AQ06730 810 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 DPYSQ14117 519 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 DPYSL3Q14195 570 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 TCEAL1Q15170 157 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 CYTH1Q15438 398 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 PARP15Q460N3 678 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 ODF2Q5BJF6 829 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 C22orf39Q6P5X5 142 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 TMCO3Q6UWJ1 677 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 DSG4Q86SJ6 1040 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 KIAA1328Q86T90 577 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM139Q8IV31 216 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 MAP7D3Q8IWC1 876 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 LZTR1Q8N653 840 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 OR2A12Q8NGT7 310 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 RAPGEF5Q92565 580 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 LOXL4Q96JB6 756 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC114Q96M63 670 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 CSPG4P5Q96PW8 444 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 HEPHQ9BQS7 1158 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 TM6SF2Q9BZW4 377 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 LACRTQ9GZZ8 138 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 BTBD1Q9H0C5 482 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 GOLPH3Q9H4A6 298 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRC19Q9H756 370 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 GRPEL1Q9HAV7 217 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 PARD6AQ9NPB6 346 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM74BQ9NUR3 256 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 SERGEFQ9UGK8 458 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 IL36AQ9UHA7 158 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 LCMT1Q9UIC8 334 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 SALL4Q9UJQ4 1053 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 PPM1HQ9ULR3 514 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 SCML1Q9UN30 329 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 ALG6Q9Y672 507 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKRD36A6QL64 1941 aa6.93□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa6.92□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa6.92□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 TBC1D3EA0A087X179 549 aa6.92□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa6.92□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A0U1RQJ8 604 aa6.92□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRD1A4D1F6 860 aa6.92□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 METTL12A8MUP2 240 aa6.92□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 PATE3B3GLJ2 98 aa6.92□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 TBC1D3LB9A6J9 549 aa6.92□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa6.92□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 ALOX15BO15296 676 aa6.92□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 PRAMEF11O60813 436 aa6.92□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 LEFTY1O75610 366 aa6.92□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 PALMO75781 387 aa6.92□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 FSBPO95073 299 aa6.92□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 MAP3K6O95382 1288 aa6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms