RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 TTC27Q6P3X3 843 aa21.62■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 ABHD2P08910 425 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 TSPAN19P0C672 248 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 COX7A2P14406 83 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 LBPP18428 481 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 RPL22P35268 128 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 POLNQ7Z5Q5 900 aa21.62■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 SQLEQ14534 574 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 PRKAG3Q9UGI9 489 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 PDHXO00330 501 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 PAICSP22234 425 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 EFCAB10A6NFE3 127 aa21.61■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 CNTN2Q02246 1040 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 DEFB128Q7Z7B8 93 aa21.61■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 LRRC19Q9H756 370 aa21.61■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 NOS2P35228 1153 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 TGFB2P61812 414 aa21.61■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa21.61■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 BBS4Q96RK4 519 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 ABCC13Q9NSE7 274 aa21.61■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 UNC5AQ6ZN44 842 aa21.6■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa21.6■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 LRRC38Q5VT99 294 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 CAMK1DQ8IU85 385 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 FAM71AQ8IYT1 594 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 PROX1Q92786 737 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 CERS2Q96G23 380 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 ARMC12Q5T9G4 340 aa21.6■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 TTKP33981 857 aa21.6■■□□□ 1.05
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PTPRM-211ENST00000580170 FAM187BQ17R55 369 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 PERM1Q5SV97 790 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 ARRDC4Q8NCT1 418 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 PSMD10O75832 226 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-211ENST00000580170 KRT73Q86Y46 540 aa21.59■■□□□ 1.05
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