RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 ATXN3LQ9H3M9 355 aa29.61■■■□□ 2.33
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CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa29.6■■■□□ 2.33
CTDNEP1-208ENST00000573600 KRT37O76014 449 aa29.6■■■□□ 2.33
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ADRA1AP35348 466 aa29.6■■■□□ 2.33
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM135Q86UB9 458 aa29.6■■■□□ 2.33
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CTDNEP1-208ENST00000573600 MAB21L3Q8N8X9 362 aa29.59■■■□□ 2.33
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CTDNEP1-208ENST00000573600 FICDQ9BVA6 458 aa29.59■■■□□ 2.33
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SOX13Q9UN79 622 aa29.59■■■□□ 2.33
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CERCAMQ5T4B2 595 aa29.59■■■□□ 2.33
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SGSM3Q96HU1 749 aa29.59■■■□□ 2.33
CTDNEP1-208ENST00000573600 MRGPRX2Q96LB1 330 aa29.59■■■□□ 2.33
CTDNEP1-208ENST00000573600 CORO1BQ9BR76 489 aa29.59■■■□□ 2.33
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCDC134Q9H6E4 229 aa29.59■■■□□ 2.33
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM169AQ9Y6X4 670 aa29.59■■■□□ 2.33
CTDNEP1-208ENST00000573600 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CCL16O15467 120 aa29.58■■■□□ 2.33
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CTDNEP1-208ENST00000573600 MT-ND3P03897 115 aa29.58■■■□□ 2.33
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF783Q6ZMS7 281 aa29.58■■■□□ 2.33
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa29.56■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 MIA3Q5JRA6 1907 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 TYROBPO43914 113 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPAG7O75391 227 aa29.55■■■□□ 2.32
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