RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	BEND5	Q7L4P6	421 aa		18.7	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	MAPK15	Q8TD08	544 aa		18.7	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	STYX	Q8WUJ0	223 aa		18.7	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	18.7	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	OR52B2	Q96RD2	323 aa		18.7	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		18.7	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		18.7	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	ACOT9	Q9Y305	439 aa		18.7	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	CLCNKB	P51801	687 aa		18.7	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	RABGGTB	P53611	331 aa		18.7	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	MAP2K5	Q13163	448 aa		18.7	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	HPS6	Q86YV9	775 aa		18.7	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	LZTR1	Q8N653	840 aa		18.7	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	SCYL1	Q96KG9	808 aa		18.7	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	FCRL5	Q96RD9	977 aa		18.7	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		18.7	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		18.7	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		18.7	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	UBP1	Q9NZI7	540 aa		18.7	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	18.7	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	TK2	O00142	265 aa		18.69	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	UPP2	O95045	317 aa		18.69	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	TFEB	P19484	476 aa		18.69	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	PIK3R1	P27986	724 aa		18.69	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	POTEH	Q6S545	545 aa		18.69	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	TAC4	Q86UU9	113 aa		18.69	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	KBTBD6	Q86V97	674 aa		18.69	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		18.69	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		18.69	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	CNTD1	Q8N815	330 aa		18.69	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	KY	Q8NBH2	561 aa		18.69	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		18.69	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	GAD1	Q99259	594 aa		18.69	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	CHST12	Q9NRB3	414 aa		18.69	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	STK39	Q9UEW8	545 aa		18.69	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	PEX1	O43933	1283 aa		18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	PIGN	O95427	931 aa		18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	MPST	P25325	297 aa		18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	MORN1	Q5T089	497 aa		18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	TMC7	Q7Z402	723 aa		18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	GBP5	Q96PP8	586 aa		18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	CDYL	Q9Y232	598 aa		18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	AHSG	P02765	367 aa		18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	CHRNG	P07510	517 aa		18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	ODC1	P11926	461 aa		18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	SERPINB5	P36952	375 aa		18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	GEM	P55040	296 aa		18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	RAB10	P61026	200 aa		18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	MED21	Q13503	144 aa		18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	RNF220	Q5VTB9	566 aa		18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	ARMC3	Q5W041	872 aa		18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	METTL23	Q86XA0	190 aa		18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	AGR3	Q8TD06	166 aa		18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	MYLPF	Q96A32	169 aa		18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	HAPLN3	Q96S86	360 aa		18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	ACBD6	Q9BR61	282 aa		18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	VPS28	Q9UK41	221 aa		18.68	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	DFFA	O00273	331 aa		18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	RAG1	P15918	1043 aa		18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	STMN1	P16949	149 aa		18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	PAM	P19021	973 aa		18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	SAT1	P21673	171 aa		18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	NUDT2	P50583	147 aa		18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	NAGLU	P54802	743 aa		18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	HERC3	Q15034	1050 aa		18.67	■□□□□ 0.58
RRN3-205	ENST00000563559	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	18.67	■□□□□ 0.58

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