RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556339.5

ATXN3-240, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 525 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-240	ENST00000556339	B3GAT3	O94766	335 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	SMC2	O95347	1197 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	LYPLA2	O95372	231 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	ASMTL	O95671	621 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	C1R	P00736	705 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	OR52Z1	P0C646	297 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	ITGAM	P11215	1152 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	PFKFB1	P16118	471 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CYP11B2	P19099	503 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	GLRA2	P23416	452 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	RARRES1	P49788	294 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	EFNA5	P52803	228 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	UBASH3A	P57075	661 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	OSTN	P61366	133 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	DSG1	Q02413	1049 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	GRIK3	Q13003	919 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	LRRC32	Q14392	662 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	PSMD5	Q16401	504 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	TEX35	Q5T0J7	233 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	KRT79	Q5XKE5	535 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	FUT10	Q6P4F1	479 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	PDXDC1	Q6P996	788 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	VSTM4	Q8IW00	320 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	MYADM	Q96S97	322 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	FNIP2	Q9P278	1114 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	TLK1	Q9UKI8	766 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	DNM3	Q9UQ16	869 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CLIC4	Q9Y696	253 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CLUH	O75153	1309 aa		4.21	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CIT	O14578	2027 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-240	ENST00000556339		A0A1B0GVL5	298 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-240	ENST00000556339	PIPSL	A2A3N6	862 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-240	ENST00000556339		F8W810	466 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-240	ENST00000556339		H7C4K7	107 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-240	ENST00000556339	ACKR2	O00590	384 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-240	ENST00000556339	PRRG1	O14668	218 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-240	ENST00000556339	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-240	ENST00000556339	ZNF185	O15231	689 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-240	ENST00000556339	TGM5	O43548	720 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-240	ENST00000556339	MED24	O75448	989 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-240	ENST00000556339	SERPINC1	P01008	464 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-240	ENST00000556339	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-240	ENST00000556339	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-240	ENST00000556339	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-240	ENST00000556339	LAMP2	P13473	410 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-240	ENST00000556339	RPA1	P27694	616 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-240	ENST00000556339	OR1D2	P34982	312 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-240	ENST00000556339	NAMPT	P43490	491 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-240	ENST00000556339	TRAPPC10	P48553	1259 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-240	ENST00000556339	PTH2R	P49190	550 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-240	ENST00000556339	SPAG1	Q07617	926 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-240	ENST00000556339	DSC1	Q08554	894 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-240	ENST00000556339	STRN3	Q13033	797 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-240	ENST00000556339	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-240	ENST00000556339	GPS2	Q13227	327 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-240	ENST00000556339	MPP3	Q13368	585 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-240	ENST00000556339	TP53BP2	Q13625	1128 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-240	ENST00000556339	TRIM14	Q14142	442 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-240	ENST00000556339	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-240	ENST00000556339	ANGPT1	Q15389	498 aa		4.21	□□□□□ -1.74

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