RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 SARNPP82979 210 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 CDK16Q00536 496 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 RAD51Q06609 339 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 C2orf54Q08AI8 447 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 LBRQ14739 615 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 PARP6Q2NL67 630 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 ARMC3Q5W041 872 aa9.49□□□□□ -0.89
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CS-220ENST00000550700 SDE2Q6IQ49 451 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 SYNPOQ8N3V7 929 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
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CS-220ENST00000550700 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
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CS-220ENST00000550700 OR7D4Q8NG98 312 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 ATG4AQ8WYN0 398 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 BHMTQ93088 406 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 LRIG1Q96JA1 1093 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 TEKT5Q96M29 485 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 PSKH2Q96QS6 385 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 PDFQ9HBH1 243 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 VPS45Q9NRW7 570 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 ELOVL2Q9NXB9 296 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 SUN2Q9UH99 717 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 VPS51Q9UID3 782 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 PIAS3Q9Y6X2 628 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 CDH23Q9H251 3354 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 COL4A2P08572 1712 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 A0A1W2PQ67 120 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 GSRP00390 522 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 IFNB1P01574 187 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 JCHAINP01591 159 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 BMP1P13497 986 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 NFKBIAP25963 317 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 PTPN3P26045 913 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 ACVRL1P37023 503 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 ADCY8P40145 1251 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 CALCOCO2Q13137 446 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 GAB4Q2WGN9 574 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 SLC44A4Q53GD3 710 aa9.48□□□□□ -0.89
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CS-220ENST00000550700 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 TTC27Q6P3X3 843 aa9.48□□□□□ -0.89
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CS-220ENST00000550700 ADIPOR2Q86V24 386 aa9.48□□□□□ -0.89
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CS-220ENST00000550700 ATP11CQ8NB49 1132 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 ERP44Q9BS26 406 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 FOXP3Q9BZS1 431 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 SLC25A51Q9H1U9 297 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 FBRSQ9HAH7 460 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 FAM114A2Q9NRY5 505 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 SEPT10Q9P0V9 454 aa9.48□□□□□ -0.89
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CS-220ENST00000550700 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
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CS-220ENST00000550700 E7EVH7 732 aa9.47□□□□□ -0.89
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CS-220ENST00000550700 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 FUT11Q495W5 492 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-220ENST00000550700 TMEM196Q5HYL7 178 aa9.47□□□□□ -0.89
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