RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519057.5

COPS5-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 5, human

TSL 4

Gene COPS5, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS5-208	ENST00000519057	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	ACP5	P13686	325 aa		4.69	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	AMT	P48728	403 aa		4.69	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	CLCNKB	P51801	687 aa		4.69	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	NUDT6	P53370	316 aa		4.69	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	CDH12	P55289	794 aa		4.69	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.69	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	BNC1	Q01954	994 aa		4.69	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	RPS6KA2	Q15349	733 aa		4.69	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		4.69	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		4.69	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		4.69	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		4.69	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		4.69	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		4.69	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		4.69	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	ACAD9	Q9H845	621 aa		4.69	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.69	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.69	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	KCND3	Q9UK17	655 aa		4.69	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		4.68	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	ARSA	P15289	507 aa		4.68	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	COASY	Q13057	564 aa		4.68	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	SERPINA11	Q86U17	422 aa		4.68	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	FJX1	Q86VR8	437 aa		4.68	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		4.68	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	SCAI	Q8N9R8	606 aa		4.68	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	TEX45	Q8NA69	505 aa		4.68	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		4.68	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	C3orf49	Q96BT1	292 aa		4.68	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	RMDN3	Q96TC7	470 aa		4.68	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	CRB3	Q9BUF7	120 aa		4.68	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		4.68	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.68	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	IL25	Q9H293	177 aa		4.68	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		4.68	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.68	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	ASAP2	O43150	1006 aa		4.67	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	SETSIP	P0DME0	302 aa		4.67	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	CYP4B1	P13584	511 aa		4.67	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	NAGA	P17050	411 aa		4.67	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	4.67	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	TRAF2	Q12933	501 aa		4.67	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	PDCL	Q13371	301 aa		4.67	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	PLCB4	Q15147	1175 aa		4.67	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		4.67	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		4.67	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	AADACL2	Q6P093	401 aa		4.67	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	RRAGA	Q7L523	313 aa		4.67	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		4.67	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	TMED6	Q8WW62	240 aa		4.67	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	LRFN1	Q9P244	771 aa		4.67	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	BAG5	Q9UL15	447 aa		4.67	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		4.66	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		4.66	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	SYN3	O14994	580 aa		4.66	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF432	O94892	652 aa		4.66	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	IGKV3-20	P01619	116 aa		4.66	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	HTR3A	P46098	478 aa		4.66	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	RPS6KA3	P51812	740 aa		4.66	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	ATG9B	Q674R7	924 aa		4.66	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		4.66	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		4.66	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	RINL	Q6ZS11	566 aa		4.66	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		4.66	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	RTP4	Q96DX8	246 aa		4.66	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		4.66	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	FIZ1	Q96SL8	496 aa		4.66	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.66	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		4.66	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	DACT1	Q9NYF0	836 aa		4.66	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		4.66	□□□□□ -1.66
COPS5-208	ENST00000519057	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057		H0Y3Z8	333 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	KCNJ13	O60928	360 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	DPP6	P42658	865 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	MVD	P53602	400 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF329	Q86UD4	541 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	RBFA	Q8N0V3	343 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	GPT2	Q8TD30	523 aa		4.65	□□□□□ -1.67
COPS5-208	ENST00000519057	NR4A3	Q92570	626 aa		4.65	□□□□□ -1.67

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