RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516577.1

RNU6-1018P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1018, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1018P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CNGA2Q16280 664 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SYT16Q17RD7 645 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SYTL3Q4VX76 610 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TMEM240Q5SV17 173 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MSANTD2Q6P1R3 559 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CRTC1Q6UUV9 634 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OVCH2Q7RTZ1 564 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NFE4Q86UQ8 179 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IGFN1Q86VF2 1251 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF584Q8IVC4 421 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LMNTD2Q8IXW0 634 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ABHD5Q8WTS1 349 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC22A17Q8WUG5 538 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OVCA2Q8WZ82 227 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 POM121L2Q96KW2 1035 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C3orf30Q96M34 536 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IWS1Q96ST2 819 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MSTO1Q9BUK6 570 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 B3GNT5Q9BYG0 378 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NOX4Q9NPH5 578 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CLIP2Q9UDT6 1046 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SNX9Q9Y5X1 595 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PSAT1Q9Y617 370 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NDUFAF8A1L188 74 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HHLA1C9JL84 531 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 F8W8V4 182 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 H3BML4 177 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CAPN9O14815 690 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MID1O15344 667 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OFD1O75665 1012 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TCEA3O75764 348 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TMCC1O94876 653 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MT-ND5P03915 603 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PF4V1P10720 104 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CDH1P12830 882 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MYF5P13349 255 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HLA-DOBP13765 273 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ACADSP16219 412 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DPEP1P16444 411 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZBTB25P24278 435 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CHRNB4P30926 498 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DPP6P42658 865 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FMO5P49326 533 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC20A2Q08357 652 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CALCRLQ16602 461 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MINDY4Q4G0A6 757 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TAF7LQ5H9L4 462 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 STXBP5Q5T5C0 1151 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RAP1GAP2Q684P5 730 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 WDR93Q6P2C0 686 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC30A9Q6PML9 568 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CEACAM20Q6UY09 585 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KRT27Q7Z3Y8 459 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SFR1Q86XK3 245 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CDC20BQ86Y33 519 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KLBQ86Z14 1044 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZBTB34Q8NCN2 500 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KLHDC9Q8NEP7 349 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TRIM58Q8NG06 486 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TMEM163Q8TC26 289 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CLEC4CQ8WTT0 213 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TMEM18Q96B42 140 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SUCLG2Q96I99 432 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C18orf12Q96KH6 178 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LRR1Q96L50 414 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LRGUKQ96M69 825 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DRC1Q96MC2 740 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FSCN3Q9NQT6 498 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ARL15Q9NXU5 204 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 USP35Q9P2H5 1018 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC9A2Q9UBY0 812 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF212Q9UDV6 495 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CACNG5Q9UF02 275 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IP6K2Q9UHH9 426 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RASAL2Q9UJF2 1139 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RAB21Q9UL25 225 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 A0A1W2PS18 150 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CFAP69A5D8W1 941 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ASPDHA6ND91 283 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LILRA5A6NI73 299 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NPC1O15118 1278 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DHHO43323 396 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PI15O43692 258 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms