RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498804.1

TRBVA-201, Transcript of T cell receptor beta variable A (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene TRBVA, Length 316 nt, Biotype TR V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBVA-201ENST00000498804 ZNF333Q96JL9 665 aa3.1□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 PIGSQ96S52 555 aa3.1□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 TRIM31Q9BZY9 425 aa3.1□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 KLHL31Q9H511 634 aa3.1□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 CXorf56Q9H5V9 222 aa3.1□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 G6PC2Q9NQR9 355 aa3.1□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 IL36RNQ9UBH0 155 aa3.1□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 CKAP5Q14008 2032 aa3.1□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 E7EVH7 732 aa3.09□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 STMND1H3BQB6 276 aa3.09□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 CST5P28325 142 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 PCYT1AP49585 367 aa3.09□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 RGS19P49795 217 aa3.09□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 CYP2J2P51589 502 aa3.09□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 RRP1P56182 461 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 FOXO1Q12778 655 aa3.09□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 TRAF3Q13114 568 aa3.09□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 FBXO43Q4G163 708 aa3.09□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 FSCBQ5H9T9 825 aa3.09□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 FNBP1LQ5T0N5 605 aa3.09□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.09□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 ZNF367Q7RTV3 350 aa3.09□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 BRSK2Q8IWQ3 736 aa3.09□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 HORMAD2Q8N7B1 307 aa3.09□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 SCAIQ8N9R8 606 aa3.09□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 GPT2Q8TD30 523 aa3.09□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 CPT1BQ92523 772 aa3.09□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 PTPRHQ9HD43 1115 aa3.09□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 THAP1Q9NVV9 213 aa3.09□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 NDUFAF4Q9P032 175 aa3.09□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 NLKQ9UBE8 527 aa3.09□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 CDH22Q9UJ99 828 aa3.09□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 SLC25A13Q9UJS0 675 aa3.09□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa3.09□□□□□ -1.91
TRBVA-201ENST00000498804 SYN3O14994 580 aa3.08□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 FAM155BO75949 473 aa3.08□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 MTNR1AP48039 350 aa3.08□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 MVDP53602 400 aa3.08□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 MORC3Q14149 939 aa3.08□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 AP5B1Q2VPB7 878 aa3.08□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 C5orf22Q49AR2 442 aa3.08□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 SH2D4BQ5SQS7 431 aa3.08□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa3.08□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 GALNT7Q86SF2 657 aa3.08□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 MYCT1Q8N699 235 aa3.08□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 CEP76Q8TAP6 659 aa3.08□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 CTDSP1Q9GZU7 261 aa3.08□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 TWSG1Q9GZX9 223 aa3.08□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 TMLHEQ9NVH6 421 aa3.08□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 OSGIN2Q9Y236 505 aa3.08□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 RAP2CQ9Y3L5 183 aa3.08□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 DENND3A2RUS2 1198 aa3.07□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 BTBD18B2RXH4 712 aa3.07□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa3.07□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 STX16O14662 325 aa3.07□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 ASAP2O43150 1006 aa3.07□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 TMCC1O94876 653 aa3.07□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 PPP1R3DO95685 299 aa3.07□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 FCGR1AP12314 374 aa3.07□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 ZNF12P17014 697 aa3.07□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 GNLYP22749 145 aa3.07□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 PRKCHP24723 683 aa3.07□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 GSTM2P28161 218 aa3.07□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 BNC1Q01954 994 aa3.07□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa3.07□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 FAM83BQ5T0W9 1011 aa3.07□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP3.07□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa3.07□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 SAMD3Q8N6K7 520 aa3.07□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 TMEM163Q8TC26 289 aa3.07□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 HDAC7Q8WUI4 952 aa3.07□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 FAR1Q8WVX9 515 aa3.07□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 FRG2BQ96QU4 278 aa3.07□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 FEM1BQ9UK73 627 aa3.07□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa3.07□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 MST1RQ04912 1400 aa3.07□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 C17orf102A2RUQ5 167 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 HSPB6O14558 160 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 LIASO43766 372 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 MMP3P08254 477 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBVA-201ENST00000498804 CYP4B1P13584 511 aa3.06□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms