RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492487.5

SMYD3-216, Transcript of SET and MYND domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMYD3, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3-216ENST00000492487 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa8.45□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa8.45□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 WDR24Q96S15 920 aa8.45□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 PRRX2Q99811 253 aa8.45□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 DYRK4Q9NR20 520 aa8.45□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa8.45□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 VPS45Q9NRW7 570 aa8.45□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 KLHL11Q9NVR0 708 aa8.45□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 DTLQ9NZJ0 730 aa8.45□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 PAK5Q9P286 719 aa8.45□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 CA14Q9ULX7 337 aa8.45□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa8.45□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 SGK1O00141 431 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 ATP9BO43861 1147 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 PHF2O75151 1096 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 ECEL1O95672 775 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 TUBBP07437 444 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 SERPINF2P08697 491 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 CXCR5P32302 372 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 CD70P32970 193 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 FDFT1P37268 417 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 GGCXP38435 758 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 SLC6A11P48066 632 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 CCR3P51677 355 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 NRLP54845 237 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 AP1S1P61966 158 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 KDSRQ06136 332 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 ITKQ08881 620 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 SLC14A2Q15849 920 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 TEX44Q53QW1 395 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 CARD16Q5EG05 197 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 ARMC3Q5W041 872 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 PID1Q7Z2X4 250 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 ADIPOR2Q86V24 386 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 C11orf74Q86VG3 221 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 SH2D3CQ8N5H7 860 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 CAMKK1Q8N5S9 505 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 TTC8Q8TAM2 541 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 OR8D1Q8WZ84 308 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 ASIC4Q96FT7 647 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 HMCESQ96FZ2 354 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.068e-7■■■■■ 30.8
SMYD3-216ENST00000492487 PSKH2Q96QS6 385 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 PSMB7Q99436 277 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 ADGRE3Q9BY15 652 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 KLC2Q9H0B6 622 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 RAB17Q9H0T7 212 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 TSPYL1Q9H0U9 437 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 LMAN1LQ9HAT1 526 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 LTB4R2Q9NPC1 389 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.062e-6■■■■□ 26.1
SMYD3-216ENST00000492487 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 ZNF212Q9UDV6 495 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 VPS51Q9UID3 782 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 SNX10Q9Y5X0 201 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 BAHCC1Q9P281 2608 aa8.44□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 CHD5Q8TDI0 1954 aa8.43□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 A0A0D9SEW6 157 aa8.43□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 C5orf60A6NFR6 353 aa8.43□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 FAM187AA6NFU0 413 aa8.43□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 E7EVH7 732 aa8.43□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 KCNN4O15554 427 aa8.43□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 LIASO43766 372 aa8.43□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 NARSO43776 548 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 MFSD11O43934 449 aa8.43□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 MAFKO60675 156 aa8.43□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 ZNF217O75362 1048 aa8.43□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 ADH1BP00325 375 aa8.43□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 ACADMP11310 421 aa8.43□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 XPAP23025 273 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 MCM3P25205 808 aa8.43□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 SERPINA4P29622 427 aa8.43□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 MARCKSL1P49006 195 aa8.43□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 LMAN1P49257 510 aa8.43□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 GEMP55040 296 aa8.43□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 RPL26P61254 145 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 CDK16Q00536 496 aa8.43□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 GBE1Q04446 702 aa8.43□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 PPP1R7Q15435 360 aa8.43□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 DLG2Q15700 870 aa8.43□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 CYP1B1Q16678 543 aa8.43□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 GEN1Q17RS7 908 aa8.43□□□□□ -1.06
SMYD3-216ENST00000492487 PARP6Q2NL67 630 aa8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms