RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491592.1

RTN4-215, Transcript of reticulon 4, human

TSL 2

Gene RTN4, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RTN4-215	ENST00000491592	MIIP	Q5JXC2	388 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	ADCK1	Q86TW2	530 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	KRT35	Q92764	455 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	RNF31	Q96EP0	1072 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	GIMAP5	Q96F15	307 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	ZNF503	Q96F45	646 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	GBP5	Q96PP8	586 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	MED15	Q96RN5	788 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	ATP6V0B	Q99437	205 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	SMO	Q99835	787 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	CDK19	Q9BWU1	502 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	DPH1	Q9BZG8	443 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		4.96	□□□□□ -1.61
RTN4-215	ENST00000491592		A0A1B0GUL7	405 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592		A0A1W2PPC4	97 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	LACTBL1	A8MY62	500 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	ZSCAN12	O43309	604 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	PEX11B	O96011	259 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	PNP	P00491	289 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	TUBB	P07437	444 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	GRP	P07492	148 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	TMEM11	P17152	192 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	THPO	P40225	353 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	GDF5	P43026	501 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	POLE2	P56282	527 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	CXADR	P78310	365 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	MXRA7	P84157	204 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	CYP4A11	Q02928	519 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	CHRND	Q07001	517 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	TCF15	Q12870	199 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	CBX3	Q13185	183 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	SLC12A1	Q13621	1099 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	TUBA3C	Q13748	450 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	CAMK4	Q16566	473 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	ZSCAN26	Q16670	478 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	PET117	Q6UWS5	81 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	USP37	Q86T82	979 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	KRT73	Q86Y46	540 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	DPP10	Q8N608	796 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	FANCB	Q8NB91	859 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	PTP4A1	Q93096	173 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	NACC2	Q96BF6	587 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	AK8	Q96MA6	479 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	TRIB1	Q96RU8	372 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RTN4-215	ENST00000491592	ADAM2	Q99965	735 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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