RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488429.5

GGTA1P-204, Transcript of glycoprotein, alpha-galactosyltransferase 1 pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene GGTA1P, Length 1,104 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTA1P-204ENST00000488429 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa8.49□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 TUBD1Q9UJT1 453 aa8.49□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 ANAPC2Q9UJX6 822 aa8.49□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 VPS28Q9UK41 221 aa8.49□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 MED13Q9UHV7 2174 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 CLEC18AA5D8T8 446 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 LMO7DNF2Z398 122 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 M0QYT0 321 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 NOBOXO60393 691 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 SLC2A3P11169 496 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 CD82P27701 267 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 CASP1P29466 404 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 CHRNA3P32297 505 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 RGS7P49802 495 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 THOP1P52888 689 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 PDX1P52945 283 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 STK4Q13043 487 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 SGCGQ13326 291 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 CUL4BQ13620 913 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 PTK2BQ14289 1009 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 NCAPHQ15003 741 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 STILQ15468 1287 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 TGIF1Q15583 401 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 TMEM259Q4ZIN3 620 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 TMEM164Q5U3C3 297 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 BORAQ6PGQ7 559 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 CLEC18BQ6UXF7 455 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 SLC35F3Q8IY50 421 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 CLEC18CQ8NCF0 446 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 LINC00301Q8NCQ3 95 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 KIAA0895Q8NCT3 520 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 TMIEQ8NEW7 156 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 UBA3Q8TBC4 463 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 MYEOVQ96EZ4 313 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 FEM1CQ96JP0 617 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 TBATAQ96M53 351 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 SLC17A9Q9BYT1 436 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 SLC13A1Q9BZW2 595 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 GPR27Q9NS67 375 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 RAB20Q9NX57 234 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 FAM13BQ9NYF5 915 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 PISDQ9UG56 409 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 PADI4Q9UM07 663 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 DOLKQ9UPQ8 538 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa8.48□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 A0A1W2PQ27 194 aa8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 A0A1W2PQ64 194 aa8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 A0A1W2PQC6 194 aa8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 POM121BA6NF01 834 aa8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 M0QYV0 167 aa8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 O00370 1275 aa8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 SYT1P21579 422 aa8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 CCKBRP32239 447 aa8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 NUMBP49757 651 aa8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 ATP1A2P50993 1020 aa8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 NEK3P51956 506 aa8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 KRT83P78385 493 aa8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 KCNAB2Q13303 367 aa8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 MTA1Q13330 715 aa8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 CUL2Q13617 745 aa8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 NFIL3Q16649 462 aa8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 SKIDA1Q1XH10 827 aa8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 PRRT3Q5FWE3 981 aa8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 SEL1L3Q68CR1 1132 aa8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 LCLAT1Q6UWP7 414 aa8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 VASH2Q86V25 355 aa8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 ATCAYQ86WG3 371 aa8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 SH2D3CQ8N5H7 860 aa8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 ATP11CQ8NB49 1132 aa8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 OR6C4Q8NGE1 309 aa8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 SLC39A13Q96H72 371 aa8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 HSFY1Q96LI6 401 aa8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 FEM1AQ9BSK4 669 aa8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 FUCA2Q9BTY2 467 aa8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 HDAC8Q9BY41 377 aa8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 MUC3BQ9H195 1237 aa8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 HS3ST2Q9Y278 367 aa8.47□□□□□ -1.05
GGTA1P-204ENST00000488429 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa8.46□□□□□ -1.06
GGTA1P-204ENST00000488429 BLACEA4D250 179 aa8.46□□□□□ -1.06
GGTA1P-204ENST00000488429 KCNU1A8MYU2 1149 aa8.46□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms