RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488157.5

NISCH-210, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-210ENST00000488157 MAN1A1P33908 653 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 DRD3P35462 400 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 ETFBP38117 255 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 ARL4AP40617 200 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 ARHGAP25P42331 645 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 NDST2P52849 883 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 ZNF33AQ06730 810 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 CYTH1Q15438 398 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 PARP15Q460N3 678 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 ARSIQ5FYB1 569 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 KIAA2013Q8IYS2 634 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 HDDC3Q8N4P3 179 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 KCTD6Q8NC69 237 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 PCDH19Q8TAB3 1148 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 GANCQ8TET4 914 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 LRRN4Q8WUT4 740 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 OR8D1Q8WZ84 308 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 FBRSQ9HAH7 460 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 GRPEL1Q9HAV7 217 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 FBXL12Q9NXK8 326 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 TRIM10Q9UDY6 481 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 GMEB2Q9UKD1 530 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 PPM1HQ9ULR3 514 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 HPCAL4Q9UM19 191 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 ALG6Q9Y672 507 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 PATE3B3GLJ2 98 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 NDUFS2O75306 463 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 TMCC1O94876 653 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 KDELR1P24390 212 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 CHRNA3P32297 505 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 MPLP40238 635 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 CLCN6P51797 869 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 HADHBP55084 474 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 ZBTB16Q05516 673 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 SLC20A2Q08357 652 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 CARD16Q5EG05 197 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 TCEAL6Q6IPX3 200 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 SLC36A4Q6YBV0 504 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 PQLC3Q8N755 202 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 PIGKQ92643 395 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 TCEAL3Q969E4 200 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 ARRDC3Q96B67 414 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 LOXL4Q96JB6 756 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 EXOC2Q96KP1 924 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 HSPA12BQ96MM6 686 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 OMDQ99983 421 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 CALN1Q9BXU9 219 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 RXFP3Q9NSD7 469 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 LHX3Q9UBR4 397 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 WASF2Q9Y6W5 498 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 SHROOM3Q8TF72 1996 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 DOCK9Q9BZ29 2069 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 FAM47DPA6NHR8 397 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 ARHGAP42A6NI28 874 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 INSIG1O15503 277 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 MFSD11O43934 449 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 PRAMEF11O60813 436 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 LEFTY1O75610 366 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 GJB3O75712 270 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 KRT7P08729 469 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 C5AR1P21730 350 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 RGRP47804 291 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 MARCKSL1P49006 195 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 VAV2P52735 878 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 CNTN1Q12860 1018 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 LLGL1Q15334 1064 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 PLA2G2CQ5R387 149 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 FAM182AQ5T1J6 154 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 LYSMD4Q5XG99 296 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 TMCO3Q6UWJ1 677 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 C11orf74Q86VG3 221 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 TPCN2Q8NHX9 752 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 FAF2Q96CS3 445 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 CEP44Q9C0F1 390 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 BTBD1Q9H0C5 482 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 FSCN3Q9NQT6 498 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-210ENST00000488157 SEMA4GQ9NTN9 838 aa12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms