RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478545.1

HIVEP1-204, Transcript of human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene HIVEP1, Length 576 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP1-204ENST00000478545 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 DCAF12L1Q5VU92 463 aa16.5■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 ANO7Q6IWH7 933 aa16.5■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 C22orf39Q6P5X5 142 aa16.5■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 Q6ZVU0 165 aa16.5■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 TMPRSS6Q8IU80 811 aa16.5■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 LRRC49Q8IUZ0 686 aa16.5■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 ATPAF2Q8N5M1 289 aa16.5■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 CCNYQ8ND76 341 aa16.5■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 OR2T3Q8NH03 318 aa16.5■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 FAM129BQ96TA1 746 aa16.5■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 HERPUD2Q9BSE4 406 aa16.5■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 TLR10Q9BXR5 811 aa16.5■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP16.5■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 EFR3BQ9Y2G0 817 aa16.5■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 KCNK3O14649 394 aa16.49■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 ENC1O14682 589 aa16.49■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 TDGF1P13385 188 aa16.49■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 PTPN7P35236 360 aa16.49■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 COPAP53621 1224 aa16.49■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 CARD16Q5EG05 197 aa16.49■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 CCDC181Q5TID7 509 aa16.49■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 BBS12Q6ZW61 710 aa16.49■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa16.49■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa16.49■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 P3H4Q92791 437 aa16.49■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 HAUS1Q96CS2 278 aa16.49■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 TM6SF2Q9BZW4 377 aa16.49■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 CEP44Q9C0F1 390 aa16.49■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 JRKLQ9Y4A0 524 aa16.49■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 H0Y858 1186 aa16.48■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 AXIN1O15169 862 aa16.48■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 TJP3O95049 919 aa16.48■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 NDUFV2P19404 249 aa16.48■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 TGM2P21980 687 aa16.48■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 CCNCP24863 283 aa16.48■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 MSNP26038 577 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 HOXA6P31267 233 aa16.48■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 NR2C2P49116 596 aa16.48■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 NRLP54845 237 aa16.48■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 PDK1Q15118 436 aa16.48■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 SEL1L2Q5TEA6 688 aa16.48■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 CHST14Q8NCH0 376 aa16.48■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 MDGA1Q8NFP4 955 aa16.48■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 OR2A12Q8NGT7 310 aa16.48■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 NSMCE1Q8WV22 266 aa16.48■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 OR8D1Q8WZ84 308 aa16.48■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 SIPA1Q96FS4 1042 aa16.48■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 MRGPRX1Q96LB2 322 aa16.48■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 TSGA13Q96PP4 275 aa16.48■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 LGMNQ99538 433 aa16.48■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 PRRX2Q99811 253 aa16.48■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 TPSD1Q9BZJ3 242 aa16.48■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 EBF1Q9UH73 591 aa16.48■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 MCF2LO15068 1137 aa16.47■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 PEX11BO96011 259 aa16.47■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 CXCR5P32302 372 aa16.47■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 RHOAP61586 193 aa16.47■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 GNG11P61952 73 aa16.47■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 RPS14P62263 151 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 SLC10A7Q0GE19 358 aa16.47■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 AP1B1Q10567 949 aa16.47■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 LBRQ14739 615 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 TMCO4Q5TGY1 634 aa16.47■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa16.47■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 RASSF3Q86WH2 238 aa16.47■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 CACUL1Q86Y37 369 aa16.47■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 CCDC13Q8IYE1 715 aa16.47■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 PRSS33Q8NF86 280 aa16.47■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 HDAC11Q96DB2 347 aa16.47■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 CCDC114Q96M63 670 aa16.47■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 ZNF599Q96NL3 588 aa16.47■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 FBRSQ9HAH7 460 aa16.47■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 KCND1Q9NSA2 647 aa16.47■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 INVSQ9Y283 1065 aa16.47■□□□□ 0.23
HIVEP1-204ENST00000478545 EML5Q05BV3 1969 aa16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.4 ms