RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461648.2

TSC2-208, Transcript of TSC complex subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene TSC2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2-208ENST00000461648 C9orf64Q5T6V5 341 aa25.97■■□□□ 1.75
TSC2-208ENST00000461648 CCDC181Q5TID7 509 aa25.97■■□□□ 1.75
TSC2-208ENST00000461648 Q6ZVU0 165 aa25.97■■□□□ 1.75
TSC2-208ENST00000461648 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
TSC2-208ENST00000461648 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
TSC2-208ENST00000461648 P3H4Q92791 437 aa25.97■■□□□ 1.75
TSC2-208ENST00000461648 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
TSC2-208ENST00000461648 HDAC11Q96DB2 347 aa25.97■■□□□ 1.75
TSC2-208ENST00000461648 ZNF599Q96NL3 588 aa25.97■■□□□ 1.75
TSC2-208ENST00000461648 TSGA13Q96PP4 275 aa25.97■■□□□ 1.75
TSC2-208ENST00000461648 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
TSC2-208ENST00000461648 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa25.96■■□□□ 1.75
TSC2-208ENST00000461648 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
TSC2-208ENST00000461648 ALDH1A2O94788 518 aa25.96■■□□□ 1.75
TSC2-208ENST00000461648 APBB3O95704 486 aa25.96■■□□□ 1.75
TSC2-208ENST00000461648 APOC2P02655 101 aa25.96■■□□□ 1.75
TSC2-208ENST00000461648 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
TSC2-208ENST00000461648 PDK1Q15118 436 aa25.96■■□□□ 1.75
TSC2-208ENST00000461648 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
TSC2-208ENST00000461648 CAMKK1Q8N5S9 505 aa25.96■■□□□ 1.75
TSC2-208ENST00000461648 HAUS1Q96CS2 278 aa25.96■■□□□ 1.75
TSC2-208ENST00000461648 OLFM3Q96PB7 478 aa25.96■■□□□ 1.75
TSC2-208ENST00000461648 FBRSQ9HAH7 460 aa25.96■■□□□ 1.75
TSC2-208ENST00000461648 FBXO4Q9UKT5 387 aa25.96■■□□□ 1.75
TSC2-208ENST00000461648 ZNF318Q5VUA4 2279 aa25.96■■□□□ 1.75
TSC2-208ENST00000461648 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 CCNCP24863 283 aa25.95■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 CYTH1Q15438 398 aa25.95■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 TMCO4Q5TGY1 634 aa25.95■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 TSSK4Q6SA08 328 aa25.95■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 CCNYQ8ND76 341 aa25.95■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 OR2T3Q8NH03 318 aa25.95■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 NSMCE1Q8WV22 266 aa25.95■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 CCDC114Q96M63 670 aa25.95■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 TNKS2Q9H2K2 1166 aa25.95■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa25.95■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 BNIP3LO60238 219 aa25.94■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 PEX11BO96011 259 aa25.94■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 LBRQ14739 615 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 ANO7Q6IWH7 933 aa25.94■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 STK40Q8N2I9 435 aa25.94■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 LRRN4Q8WUT4 740 aa25.94■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 LGMNQ99538 433 aa25.94■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 BRD8Q9H0E9 1235 aa25.94■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 TDGF1P13385 188 aa25.93■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 GABRG2P18507 467 aa25.93■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 HOXA6P31267 233 aa25.93■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 COPAP53621 1224 aa25.93■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 RHOAP61586 193 aa25.93■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 ZNF33AQ06730 810 aa25.93■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 ANGPT1Q15389 498 aa25.93■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 CARD16Q5EG05 197 aa25.93■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 CCDC13Q8IYE1 715 aa25.93■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 OR2A12Q8NGT7 310 aa25.93■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 HMGB4Q8WW32 186 aa25.93■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 FATE1Q969F0 183 aa25.93■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 TM6SF2Q9BZW4 377 aa25.93■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP25.93■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 LHX3Q9UBR4 397 aa25.93■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 MATN3O15232 486 aa25.92■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 GSRP00390 522 aa25.92■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 NDUFV2P19404 249 aa25.92■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 CXCR5P32302 372 aa25.92■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 SLC10A7Q0GE19 358 aa25.92■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 AP1B1Q10567 949 aa25.92■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 NOMO1Q15155 1222 aa25.92■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 RASSF3Q86WH2 238 aa25.92■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 TMPRSS6Q8IU80 811 aa25.92■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 PLPP6Q8IY26 295 aa25.92■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 MDGA1Q8NFP4 955 aa25.92■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 ACTL9Q8TC94 416 aa25.92■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 OR8D1Q8WZ84 308 aa25.92■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 MAML1Q92585 1016 aa25.92■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 WDR24Q96S15 920 aa25.92■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 FAM129BQ96TA1 746 aa25.92■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 SLC6A17Q9H1V8 727 aa25.92■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 SEPT3Q9UH03 358 aa25.92■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 EBF1Q9UH73 591 aa25.92■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa25.91■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 MCF2LO15068 1137 aa25.91■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 ALOX15BO15296 676 aa25.91■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 CEP104O60308 925 aa25.91■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 PXNP49023 591 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
TSC2-208ENST00000461648 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms