RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428892.1

APOBEC3C-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3C, Length 1,056 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa11.14□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 SFMBT2Q5VUG0 894 aa11.14□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 RAP1GAP2Q684P5 730 aa11.14□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 ACAD10Q6JQN1 1059 aa11.14□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 USP30Q70CQ3 517 aa11.14□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 GPR155Q7Z3F1 870 aa11.14□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMC6Q7Z403 805 aa11.14□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 MFN1Q8IWA4 741 aa11.14□□□□□ -0.63
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APOBEC3C-202ENST00000428892 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa11.14□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
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APOBEC3C-202ENST00000428892 C3orf20Q8ND61 904 aa11.14□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 JOSD2Q8TAC2 188 aa11.14□□□□□ -0.63
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APOBEC3C-202ENST00000428892 CFAP57Q96MR6 1250 aa11.14□□□□□ -0.63
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APOBEC3C-202ENST00000428892 NRSN2Q9GZP1 204 aa11.14□□□□□ -0.63
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APOBEC3C-202ENST00000428892 PRORYQ9H606 182 aa11.14□□□□□ -0.63
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APOBEC3C-202ENST00000428892 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 TAS2R14Q9NYV8 317 aa11.14□□□□□ -0.63
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APOBEC3C-202ENST00000428892 CAPN11Q9UMQ6 739 aa11.14□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa11.14□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 BPTFQ12830 3046 aa11.14□□□□□ -0.63
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APOBEC3C-202ENST00000428892 CAPN8A6NHC0 703 aa11.13□□□□□ -0.63
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APOBEC3C-202ENST00000428892 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 PLSCR2Q9NRY7 297 aa11.13□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM51Q9NW97 253 aa11.13□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 STIM2Q9P246 746 aa11.13□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 HS3ST4Q9Y661 456 aa11.13□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 DOCK9Q9BZ29 2069 aa11.12□□□□□ -0.63
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APOBEC3C-202ENST00000428892 MID1O15344 667 aa11.12□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 SIN3BO75182 1162 aa11.12□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 PAGE1O75459 146 aa11.12□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 C1QL1O75973 258 aa11.12□□□□□ -0.63
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APOBEC3C-202ENST00000428892 MOCS3O95396 460 aa11.12□□□□□ -0.63
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APOBEC3C-202ENST00000428892 TPM1P09493 284 aa11.12□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRT3P12035 628 aa11.12□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 GZMAP12544 262 aa11.12□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 TNFAIP3P21580 790 aa11.12□□□□□ -0.63
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APOBEC3C-202ENST00000428892 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 CD70P32970 193 aa11.12□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 PSMD8P48556 350 aa11.12□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 IRAK1P51617 712 aa11.12□□□□□ -0.63
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APOBEC3C-202ENST00000428892 DEUP1Q05D60 604 aa11.12□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 KLHL30Q0D2K2 578 aa11.12□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 CDH18Q13634 790 aa11.12□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 AUHQ13825 339 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 CST6Q15828 149 aa11.12□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 FSCBQ5H9T9 825 aa11.12□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 WDR59Q6PJI9 974 aa11.12□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.631e-11■■□□□ 13.3
APOBEC3C-202ENST00000428892 STRADAQ7RTN6 431 aa11.12□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 C14orf80Q86SX3 495 aa11.12□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 CHSY1Q86X52 802 aa11.12□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 LGI2Q8N0V4 545 aa11.12□□□□□ -0.63
APOBEC3C-202ENST00000428892 CFAP52Q8N1V2 620 aa11.12□□□□□ -0.63
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