RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 NIPA2Q8N8Q9 360 aa10.96□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa10.96□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 FOXJ1Q92949 421 aa10.96□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 OMDQ99983 421 aa10.96□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 SLC39A8Q9C0K1 460 aa10.96□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa10.96□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 MAGEH1Q9H213 219 aa10.96□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 RETREG1Q9H6L5 497 aa10.96□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 LRRC19Q9H756 370 aa10.96□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 ZWILCHQ9H900 591 aa10.96□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 SGK2Q9HBY8 427 aa10.96□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 OSGEPQ9NPF4 335 aa10.96□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 ETNK2Q9NVF9 386 aa10.96□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 SCML1Q9UN30 329 aa10.96□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 WASF2Q9Y6W5 498 aa10.96□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 C4orf47A7E2U8 309 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 J3KR12 359 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 WNT9AO14904 365 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 AKR1B10O60218 316 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 LEFTY1O75610 366 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 FSBPO95073 299 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 CFIP05156 583 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 SERPINF2P08697 491 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 CD48P09326 243 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 ENGP17813 658 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 ERCC2P18074 760 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 IL4RP24394 825 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 HOXD12P35452 270 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 MAPK8P45983 427 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 LIMK1P53667 647 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 TAS2R40P59535 323 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 SLC20A2Q08357 652 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 DPYSQ14117 519 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 DPYSL2Q16555 572 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 DUOXA1Q1HG43 343 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 CARD16Q5EG05 197 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 ARSIQ5FYB1 569 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 WDR45BQ5MNZ6 344 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 AGBL4Q5VU57 503 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 AFMIDQ63HM1 303 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 KIAA0895LQ68EN5 471 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 RETSATQ6NUM9 610 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 POLNQ7Z5Q5 900 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 OR6K2Q8NGY2 324 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 OR14C36Q8NHC7 312 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 SNX19Q92543 992 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 HSPH1Q92598 858 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 TM6SF2Q9BZW4 377 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 CEP44Q9C0F1 390 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 PDFQ9HBH1 243 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 IP6K2Q9UHH9 426 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 FZD4Q9ULV1 537 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 SLC6A14Q9UN76 642 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa10.95□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa10.94□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 SPTBN2O15020 2390 aa10.94□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 ALOX15BO15296 676 aa10.94□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 BUB1O43683 1085 aa10.94□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 TMCC1O94876 653 aa10.94□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 H2AFZP0C0S5 128 aa10.94□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM253P0C7T8 217 aa10.94□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 DESP17661 470 aa10.94□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 AMPD1P23109 780 aa10.94□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 DNA2P51530 1060 aa10.94□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 ARSEP51690 589 aa10.94□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 MMRN1Q13201 1228 aa10.94□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 SERINC3Q13530 473 aa10.94□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 ACAP1Q15027 740 aa10.94□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 CYTH1Q15438 398 aa10.94□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 SYCP2LQ5T4T6 812 aa10.94□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 H2AFVQ71UI9 128 aa10.94□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 CNGA4Q8IV77 575 aa10.94□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 TMIEQ8NEW7 156 aa10.94□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 OR2T34Q8NGX1 318 aa10.94□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 CEP76Q8TAP6 659 aa10.94□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 TSC1Q92574 1164 aa10.94□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 RTKNQ9BST9 563 aa10.94□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
ATG4B-210ENST00000428861 PCED1AQ9H1Q7 454 aa10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms