RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368671.3

CLRN3-201, Transcript of clarin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN3, Length 1,152 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN3-201ENST00000368671 CHRNA3P32297 505 aa10.59□□□□□ -0.71
CLRN3-201ENST00000368671 DAB2P98082 770 aa10.59□□□□□ -0.71
CLRN3-201ENST00000368671 OVGP1Q12889 678 aa10.59□□□□□ -0.71
CLRN3-201ENST00000368671 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CLRN3-201ENST00000368671 C5orf22Q49AR2 442 aa10.59□□□□□ -0.71
CLRN3-201ENST00000368671 HS1BP3Q53T59 392 aa10.59□□□□□ -0.71
CLRN3-201ENST00000368671 BRMS1LQ5PSV4 323 aa10.59□□□□□ -0.71
CLRN3-201ENST00000368671 LINGO4Q6UY18 593 aa10.59□□□□□ -0.71
CLRN3-201ENST00000368671 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa10.59□□□□□ -0.71
CLRN3-201ENST00000368671 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa10.59□□□□□ -0.71
CLRN3-201ENST00000368671 CHST14Q8NCH0 376 aa10.59□□□□□ -0.71
CLRN3-201ENST00000368671 OR2A12Q8NGT7 310 aa10.59□□□□□ -0.71
CLRN3-201ENST00000368671 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa10.59□□□□□ -0.71
CLRN3-201ENST00000368671 NPY6RQ99463 290 aa10.59□□□□□ -0.71
CLRN3-201ENST00000368671 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CLRN3-201ENST00000368671 CALN1Q9BXU9 219 aa10.59□□□□□ -0.71
CLRN3-201ENST00000368671 TNKS2Q9H2K2 1166 aa10.59□□□□□ -0.71
CLRN3-201ENST00000368671 CAAP1Q9H8G2 361 aa10.59□□□□□ -0.71
CLRN3-201ENST00000368671 SIX2Q9NPC8 291 aa10.59□□□□□ -0.71
CLRN3-201ENST00000368671 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa10.59□□□□□ -0.71
CLRN3-201ENST00000368671 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa10.59□□□□□ -0.71
CLRN3-201ENST00000368671 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP10.59□□□□□ -0.71
CLRN3-201ENST00000368671 MPP6Q9NZW5 540 aa10.59□□□□□ -0.71
CLRN3-201ENST00000368671 VPS51Q9UID3 782 aa10.59□□□□□ -0.71
CLRN3-201ENST00000368671 STAP1Q9ULZ2 295 aa10.59□□□□□ -0.71
CLRN3-201ENST00000368671 CLCA2Q9UQC9 943 aa10.59□□□□□ -0.71
CLRN3-201ENST00000368671 HS3ST2Q9Y278 367 aa10.59□□□□□ -0.71
CLRN3-201ENST00000368671 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CLRN3-201ENST00000368671 A0A0D9SEW6 157 aa10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 I6L893 689 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 TRIM38O00635 465 aa10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 RRP8O43159 456 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 ENDOD1O94919 500 aa10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 PCDH8O95206 1070 aa10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 ACP1P24666 158 aa10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 AKT2P31751 481 aa10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 CXCR3P49682 368 aa10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 CLDN2P57739 230 aa10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 CCDC15Q0P6D6 951 aa10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 KCNMA1Q12791 1236 aa10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 ILKQ13418 452 aa10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 RAPGEF1Q13905 1077 aa10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 RTP5Q14D33 572 aa10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 C22orf39Q6P5X5 142 aa10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 LRRC31Q6UY01 552 aa10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 KDM7AQ6ZMT4 941 aa10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 TMC6Q7Z403 805 aa10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 HORMAD1Q86X24 394 aa10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 IRF2BP1Q8IU81 584 aa10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 DCAF4L2Q8NA75 395 aa10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 TMEM35BQ8NCS4 154 aa10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 OR13H1Q8NG92 308 aa10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 OR7D4Q8NG98 312 aa10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 TBCBQ99426 244 aa10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 SPON2Q9BUD6 331 aa10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 FAM117AQ9C073 453 aa10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 NRSN2Q9GZP1 204 aa10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 UCKL1Q9NWZ5 548 aa10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 RRN3Q9NYV6 651 aa10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 IL36AQ9UHA7 158 aa10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa10.58□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 FAM208BQ5VWN6 2430 aa10.57□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 GOLGA8SH3BPF8 625 aa10.57□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 BRINP1O60477 761 aa10.57□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 SRGAP2O75044 1071 aa10.57□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 PRNPP04156 253 aa10.57□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 JUNDP17535 347 aa10.57□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 DGKAP23743 735 aa10.57□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 OR1E1P30953 314 aa10.57□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 MAN2A1Q16706 1144 aa10.57□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF284Q2VY69 593 aa10.57□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 C2CD6Q53TS8 623 aa10.57□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa10.57□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 TAF3Q5VWG9 929 aa10.57□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 SEL1L3Q68CR1 1132 aa10.57□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 NEK5Q6P3R8 708 aa10.57□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 GCNT7Q6ZNI0 430 aa10.57□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF683Q8IZ20 524 aa10.57□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 SLC25A45Q8N413 288 aa10.57□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 TMEM145Q8NBT3 493 aa10.57□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 TMIEQ8NEW7 156 aa10.57□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 BAP1Q92560 729 aa10.57□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 C18orf8Q96DM3 657 aa10.57□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 PPP1R16AQ96I34 528 aa10.57□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 KLHL11Q9NVR0 708 aa10.57□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CLRN3-201ENST00000368671 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms