RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM47DPA6NHR8 397 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF103O00237 685 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGAP33O14559 1287 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRPSAP2O60256 369 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 MFAP3LO75121 409 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYP1A2P05177 515 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHRNA3P32297 505 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNTN1Q12860 1018 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERMARDQ5T6L9 678 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 AGBL4Q5VU57 503 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 SARM1Q6SZW1 724 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR8K1Q8NGG5 319 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 HMCESQ96FZ2 354 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUP85Q9BW27 656 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 WASF2Q9Y6W5 498 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC72A6NJI9 287 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC7A4O43246 635 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 KDELR3O43731 214 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCF4P15884 667 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD27P26842 260 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL1R2P27930 398 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCK1P35558 622 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRIK2Q13002 908 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 LEKR1Q6ZMV7 388 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMIEQ8NEW7 156 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2I1PQ8NGU4 316 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR14C36Q8NHC7 312 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 BTBD6Q96KE9 485 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 NCAPGQ9BPX3 1015 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLC2Q9H0B6 622 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 OSGEPQ9NPF4 335 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABHD10Q9NUJ1 306 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 KNL1Q8NG31 2342 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 RASA4BC9J798 803 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 RASA4O43374 803 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRNPP04156 253 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYPP08247 313 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP2CBP62714 309 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP2CAP67775 309 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 BNC1Q01954 994 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACAP1Q15027 740 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC18A3Q16572 532 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 UAP1L1Q3KQV9 507 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 PARP15Q460N3 678 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPM1JQ5JR12 505 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 RFX8Q6ZV50 586 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 MINDY1Q8N5J2 469 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 NIPA2Q8N8Q9 360 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARRDC3Q96B67 414 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 TM6SF2Q9BZW4 377 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 EBF2Q9HAK2 575 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 TM9SF3Q9HD45 589 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL36AQ9UHA7 158 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANAPC7Q9UJX3 599 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 HPCAL4Q9UM19 191 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 TPM1P09493 284 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCR5P51681 352 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADKP55263 362 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 CARD16Q5EG05 197 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 PACSIN1Q9BY11 444 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC19Q9H756 370 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 IP6K2Q9UHH9 426 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM131Q92545 1883 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1W2PPC4 97 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 BUB1O43683 1085 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 LEFTY1O75610 366 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 GSRP00390 522 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNA2P51530 1060 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAS2R38P59533 333 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRCAP-201ENST00000326294 FOXK2Q01167 660 aa19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms