RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 PAK5Q9P286 719 aa20.4■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 OR12D3Q9UGF7 316 aa20.4■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 HS3ST4Q9Y661 456 aa20.4■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 NUP205Q92621 2012 aa20.4■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 SOBPA7XYQ1 873 aa20.39■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 CHADO15335 359 aa20.39■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 ASMTLO95671 621 aa20.39■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 KLKB1P03952 638 aa20.39■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 SPARCL1Q14515 664 aa20.39■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 KCNJ11Q14654 390 aa20.39■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 SLC9A4Q6AI14 798 aa20.39■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 DENND1CQ8IV53 801 aa20.39■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 FBF1Q8TES7 1133 aa20.39■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 GRAMD1AQ96CP6 724 aa20.39■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 RTP4Q96DX8 246 aa20.39■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 OSBPL2Q9H1P3 480 aa20.39■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 CCL26Q9Y258 94 aa20.39■□□□□ 0.86
CLN8-208ENST00000635751 GOT1P17174 413 aa20.39■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 TAC1P20366 129 aa20.39■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 MS4A13Q5J8X5 152 aa20.39■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 PIK3R6Q5UE93 754 aa20.39■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 ADGRD1Q6QNK2 874 aa20.39■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 DEFB123Q8N688 67 aa20.39■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 PQLC3Q8N755 202 aa20.39■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 FAF2Q96CS3 445 aa20.39■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 DHRS4Q9BTZ2 278 aa20.39■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 USP29Q9HBJ7 922 aa20.39■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 ZMYM5Q9UJ78 669 aa20.39■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 SLC12A4Q9UP95 1085 aa20.39■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa20.39■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 DENND4AQ7Z401 1863 aa20.38■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 SEMA3BQ13214 749 aa20.38■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 NPAS3Q8IXF0 933 aa20.38■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 PCDH19Q8TAB3 1148 aa20.38■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 FGF13Q92913 245 aa20.38■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 GUCD1Q96NT3 240 aa20.38■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 PAFAH2Q99487 392 aa20.38■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 KIF9Q9HAQ2 790 aa20.38■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 TDP1Q9NUW8 608 aa20.38■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa20.38■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 MYOFQ9NZM1 2061 aa20.38■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 LEFTY2O00292 366 aa20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 KCNN4O15554 427 aa20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 ACSL4O60488 711 aa20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 FOXN2P32314 431 aa20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 ARL4AP40617 200 aa20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 NRLP54845 237 aa20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 CBLBQ13191 982 aa20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 NADSYN1Q6IA69 706 aa20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 C14orf80Q86SX3 495 aa20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 C4orf33Q8N1A6 199 aa20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 C1orf74Q96LT6 269 aa20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 SLC40A1Q9NP59 571 aa20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 CFAP97Q9P2B7 532 aa20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 HEY1Q9Y5J3 304 aa20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 TYROBPO43914 113 aa20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 GREM1O60565 184 aa20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 LRIG2O94898 1065 aa20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 PRAMEF12O95522 483 aa20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 CA4P22748 312 aa20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 MSH2P43246 934 aa20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 SLC11A2P49281 568 aa20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 RAP1GAP2Q684P5 730 aa20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 RGS9BPQ6ZS82 235 aa20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 SH3RF2Q8TEC5 729 aa20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 RIPOR3Q96MK2 946 aa20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 CSPG4P5Q96PW8 444 aa20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 ABCF3Q9NUQ8 709 aa20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 CHMP2BQ9UQN3 213 aa20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa20.37■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 A0A1W2PPM1 405 aa20.36■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 SPAG6O75602 509 aa20.36■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 RASSF9O75901 435 aa20.36■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 FOSL2P15408 326 aa20.36■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 ELK3P41970 407 aa20.36■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 XRCC4Q13426 336 aa20.36■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 C4orf22Q6V702 233 aa20.36■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 AZIN2Q96A70 460 aa20.36■□□□□ 0.85
CLN8-208ENST00000635751 CYTH2Q99418 400 aa20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms