RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611151.4

RAB18-208, Transcript of RAB18, member RAS oncogene family, human

TSL 5 BASIC

Gene RAB18, Length 4,931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB18-208	ENST00000611151	ABL2	P42684	1182 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	PFKP	Q01813	784 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	HGH1	Q9BTY7	390 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	KRT84	Q9NSB2	600 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	IL1B	P01584	269 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	ALLC	Q8N6M5	410 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	MAGED4	Q96JG8	741 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	NLN	Q9BYT8	704 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	LRRC19	Q9H756	370 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF839	A8K0R7	811 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	ZW10	O43264	779 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	ITGAV	P06756	1048 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	GSTM1	P09488	218 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	ATP6V1B2	P21281	511 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	GPR15	P49685	360 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	NDUFV1	P49821	464 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	IRF8	Q02556	426 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	VPS33A	Q96AX1	596 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	LHX5	Q9H2C1	402 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	NOD2	Q9HC29	1040 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151		A0A087X1B8	175 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	SNTN	A6NMZ2	147 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	ANXA5	P08758	320 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	SKP1	P63208	163 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	TAF10	Q12962	218 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	POMK	Q9H5K3	350 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	PIF1	Q9H611	641 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	FCHO1	O14526	889 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	CYP7B1	O75881	506 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	MMP8	P22894	467 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	PTPN4	P29074	926 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	TTPA	P49638	278 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	MAX	P61244	160 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	CHPF	Q8IZ52	775 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	RCCD1	A6NED2	376 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	WDR47	O94967	919 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	ARL2	P36404	184 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	SCTR	P47872	440 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	C16orf46	Q6P387	395 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	STRADA	Q7RTN6	431 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	ELMO1	Q92556	727 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	PIGN	O95427	931 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	GSN	P06396	782 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	NAGLU	P54802	743 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	CORO7	P57737	925 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	TAS2R40	P59535	323 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	VAC14	Q08AM6	782 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	STK39	Q9UEW8	545 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	SH3BGRL	O75368	114 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	PIRT	P0C851	137 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	SMPD1	P17405	629 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	GPR1	P46091	355 aa		13.96	□□□□□ -0.17

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms