RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 MBLAC2Q68D91 279 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 PAQR9Q6ZVX9 377 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 ATPAF2Q8N5M1 289 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 LZTR1Q8N653 840 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 TEX9Q8N6V9 391 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 RDH11Q8TC12 318 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 NSMCE1Q8WV22 266 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 RNF34Q969K3 372 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 PCED1BQ96HM7 432 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 RILPQ96NA2 401 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 GAD1Q99259 594 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 RBBP8Q99708 897 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 SMOQ99835 787 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 ACBD6Q9BR61 282 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 COLEC11Q9BWP8 271 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 WDCPQ9H6R7 721 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 UGT1A7Q9HAW7 530 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 UGT1A10Q9HAW8 530 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 UGT1A8Q9HAW9 530 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 KCNK13Q9HB14 408 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 DNAJC28Q9NX36 388 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 FLRT1Q9NZU1 646 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 CDY1Q9Y6F8 540 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 TSC2P49815 1807 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 TRIP11Q15643 1979 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 ARL5CA6NH57 179 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 ARHGAP42A6NI28 874 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 YJEFN3A6XGL0 299 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 NRP1O14786 923 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 MAGEC1O60732 1142 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 DIAPH2O60879 1101 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 PEX11AO75192 247 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 NEBLO76041 1014 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 BEST1O76090 585 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 F11P03951 625 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 CYP11A1P05108 521 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 USP17L7P0C7H9 530 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 GRIA1P42261 906 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 MAGEA12P43365 314 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 POLD2P49005 469 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 NDUFV1P49821 464 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 CLCNKBP51801 687 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 HUNKP57058 714 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 INHBEP58166 350 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 CDH17Q12864 832 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 FSCBQ5H9T9 825 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 CFAP157Q5JU67 520 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 PDPK2PQ6A1A2 396 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 C4orf50Q6ZRC1 276 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 SERINC5Q86VE9 423 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 RASAL3Q86YV0 1011 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 TMPRSS6Q8IU80 811 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 LRRC49Q8IUZ0 686 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 LMNTD2Q8IXW0 634 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC33Q8N5R6 958 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 ARNTL2Q8WYA1 636 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 TSGA13Q96PP4 275 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 MECRQ9BV79 373 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 TKTL2Q9H0I9 626 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 OSBPL2Q9H1P3 480 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 SNX15Q9NRS6 342 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 ARL8BQ9NVJ2 186 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 DONSONQ9NYP3 566 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 FNIP2Q9P278 1114 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 SOX13Q9UN79 622 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 HMX2A2RU54 273 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 MYBPHLA2RUH7 354 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 CASTOR2A6NHX0 329 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 F5H423 210 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 KCNK1O00180 336 aa9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms