RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 SH3GL2Q99962 352 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 NTMT1Q9BV86 223 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 CARD6Q9BX69 1037 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 PACSIN1Q9BY11 444 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 GPR87Q9BY21 358 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 NUF2Q9BZD4 464 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 OR10A5Q9H207 317 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 IFT22Q9H7X7 185 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 IPPKQ9H8X2 491 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 FAM114A2Q9NRY5 505 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 UCKL1Q9NWZ5 548 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 WWOXQ9NZC7 414 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 BTBD7Q9P203 1132 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 CACNG4Q9UBN1 327 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 TRPS1Q9UHF7 1281 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 TLK1Q9UKI8 766 aa3.16□□□□□ -1.9
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PTPRM-204ENST00000577468 CHMP2BQ9UQN3 213 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 DERAQ9Y315 318 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 SH3GLB1Q9Y371 365 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ATP23Q9Y6H3 246 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 COX11Q9Y6N1 276 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 SH3TC1Q8TE82 1336 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1W2PQU0 124 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ARHGEF37A1IGU5 675 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ERICH2A1L162 156 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 GRID2IPA4D2P6 1211 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CAPN8A6NHC0 703 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PROB1E7EW31 1015 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 F8W8V4 182 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 H0YAE9 185 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 GOLGA8RI6L899 631 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 K7ERQ8 282 aa3.15□□□□□ -1.91
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PTPRM-204ENST00000577468 PGRMC2O15173 223 aa3.15□□□□□ -1.91
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PTPRM-204ENST00000577468 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 FAM20BO75063 409 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SMIM24O75264 130 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ABHD16AO95870 558 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CLPTM1O96005 669 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PNPP00491 289 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 AFPP02771 609 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
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PTPRM-204ENST00000577468 FGF4P08620 206 aa3.15□□□□□ -1.91
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PTPRM-204ENST00000577468 DLDP09622 509 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
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PTPRM-204ENST00000577468 CALM2P0DP24 149 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CALM3P0DP25 149 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PYGMP11217 842 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 RALAP11233 206 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CKMT1AP12532 417 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 POU2F1P14859 743 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
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PTPRM-204ENST00000577468 GLRA2P23416 452 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP3.15□□□□□ -1.919e-7■■■■■ 28.6
PTPRM-204ENST00000577468 ALDH3A1P30838 453 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CIITAP33076 1130 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 LSP1P33241 339 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ETV5P41161 510 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 POU3F4P49335 361 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 AMPHP49418 695 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PRIM2P49643 509 aa3.15□□□□□ -1.91
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PTPRM-204ENST00000577468 LGALS3BPQ08380 585 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ARHGAP19Q14CB8 494 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 LLGL1Q15334 1064 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 UGP2Q16851 508 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 FIGNQ5HY92 759 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CEP85LQ5SZL2 805 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PGM2L1Q6PCE3 622 aa3.15□□□□□ -1.91
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