RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563340.1

ATP2C2-204, Transcript of ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 2, human

TSL 3

Gene ATP2C2, Length 575 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP2C2-204	ENST00000563340	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	IL12RB2	Q99665	862 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	BOC	Q9BWV1	1114 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	KLF15	Q9UIH9	416 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	RP1	P56715	2156 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	POM121B	A6NF01	834 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	PIK3R2	O00459	728 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	PCDH8	O95206	1070 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	FYN	P06241	537 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	LIPC	P11150	499 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	VDR	P11473	427 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	NR2F2	P24468	414 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	UGT1A5	P35504	534 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	CUL4A	Q13619	759 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	NFIL3	Q16649	462 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	CHSY1	Q86X52	802 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	JAML	Q86YT9	394 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	LMX1A	Q8TE12	382 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	GLMN	Q92990	594 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ATP2C2-204	ENST00000563340	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	BNIP3L	O60238	219 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	FBXO21	O94952	628 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	APOE	P02649	317 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	CTSL	P07711	333 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	JUND	P17535	347 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	RABIF	P47224	123 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	MXI1	P50539	228 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	TMIE	Q8NEW7	156 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	ALG14	Q96F25	216 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	DYRK4	Q9NR20	520 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	MTMR6	Q9Y217	621 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340		F5H5T6	163 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	CHRNA3	P32297	505 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	FOXK1	P85037	733 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	CUL2	Q13617	745 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	MORC3	Q14149	939 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	CLCA4	Q14CN2	919 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	C8orf34	Q49A92	452 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	MANEA	Q5SRI9	462 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	TAC4	Q86UU9	113 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	RNF34	Q969K3	372 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	HSFY1	Q96LI6	401 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	HDAC8	Q9BY41	377 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ATP2C2-204	ENST00000563340	STRADB	Q9C0K7	418 aa		13.69	□□□□□ -0.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms