RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560715.5

TSPAN3-209, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN3, Length 2,892 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-209ENST00000560715 EYA3Q99504 573 aa6.9□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.9□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 BLZF1Q9H2G9 400 aa6.9□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 SNX15Q9NRS6 342 aa6.9□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa6.9□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa6.9□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa6.9□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 COG5Q9UP83 839 aa6.9□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 NUMBLQ9Y6R0 609 aa6.9□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 RTL9Q8NET4 1388 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 MAST3O60307 1309 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 PRSS38A1L453 326 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 TAF4O00268 1085 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 KRIT1O00522 736 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 NDC80O14777 642 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 MMP1P03956 469 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 RPL5P46777 297 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 TKTL1P51854 596 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 NAA20P61599 178 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 ADAM15Q13444 863 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 BMPR2Q13873 1038 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 KRBOX4Q5JUW0 171 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 C6orf183Q5T699 404 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 VSTM1Q6UX27 236 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 FRMD7Q6ZUT3 714 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 SFR1Q86XK3 245 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 GRK7Q8WTQ7 553 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 PTP4A1Q93096 173 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 PI4K2AQ9BTU6 479 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 PITPNM3Q9BZ71 974 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 NDEL1Q9GZM8 345 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 SAR1AQ9NR31 198 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 GDAQ9Y2T3 454 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 STARD13Q9Y3M8 1113 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 CASZ1Q86V15 1759 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 DOCK2Q92608 1830 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 A4D1N5 150 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 A8MXQ7 604 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 SIN3BO75182 1162 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 ITPK1Q13572 414 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 SUSD4Q5VX71 490 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 PPP1R3BQ86XI6 285 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 CPNE8Q86YQ8 564 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 ARHGAP24Q8N264 748 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 ESR2Q92731 530 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 USP6NLQ92738 828 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 NT5C3AQ9H0P0 336 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 SAYSD1Q9NPB0 183 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 GPR27Q9NS67 375 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 SELENONQ9NZV5 590 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 NOX1Q9Y5S8 564 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 PLOD2O00469 737 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 TGFB1I1O43294 461 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 CCDC22O60826 627 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 CELA3BP08861 270 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 GZMAP12544 262 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 TAC1P20366 129 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 KLRK1P26718 216 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 TKTP29401 623 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 NNMTP40261 264 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 SLCO1A2P46721 670 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 SLC16A1P53985 500 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 COG7P83436 770 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 KLRC3Q07444 240 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 CHAF1BQ13112 559 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 TGFBIQ15582 683 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 OASLQ15646 514 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 GPR68Q15743 365 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 CRY1Q16526 586 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 MIIPQ5JXC2 388 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 STXBP5Q5T5C0 1151 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 METTL21CQ5VZV1 264 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
TSPAN3-209ENST00000560715 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.3 ms