RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560359.1

GABPB1-AS1-204, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene GABPB1-AS1, Length 709 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CLCN6P51797 869 aa24.49■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TFDP3Q5H9I0 405 aa24.49■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SLC9A4Q6AI14 798 aa24.49■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CAMKK1Q8N5S9 505 aa24.49■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ATP11CQ8NB49 1132 aa24.49■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ALG3Q92685 438 aa24.49■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HES6Q96HZ4 224 aa24.49■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PRRX2Q99811 253 aa24.49■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP24.49■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa24.48■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa24.48■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 APOL1O14791 398 aa24.48■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 APBB3O95704 486 aa24.48■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 COPS2P61201 443 aa24.48■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DLG2Q15700 870 aa24.48■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PPP2R5EQ16537 467 aa24.48■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TSSK4Q6SA08 328 aa24.48■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TP53INP2Q8IXH6 220 aa24.48■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PLD5Q8N7P1 536 aa24.48■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FRS2Q8WU20 508 aa24.48■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ERLEC1Q96DZ1 483 aa24.48■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SHROOM3Q8TF72 1996 aa24.47■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa24.47■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 K7ERQ8 282 aa24.47■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PRAMEF11O60813 436 aa24.47■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ALDH1A2O94788 518 aa24.47■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CD160O95971 181 aa24.47■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HOXA6P31267 233 aa24.47■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ACCSLQ4AC99 568 aa24.47■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CEP44Q9C0F1 390 aa24.47■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MTG2Q9H4K7 406 aa24.47■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PDFQ9HBH1 243 aa24.47■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PRSS16Q9NQE7 514 aa24.47■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ACTL7AQ9Y615 435 aa24.47■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SIN3BO75182 1162 aa24.46■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KRT10P13645 584 aa24.46■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GBE1Q04446 702 aa24.46■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TFDP2Q14188 446 aa24.46■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF528Q3MIS6 628 aa24.46■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MEI1Q5TIA1 1274 aa24.46■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KAZNQ674X7 775 aa24.46■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C22orf39Q6P5X5 142 aa24.46■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LEKR1Q6ZMV7 388 aa24.46■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa24.46■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RASSF3Q86WH2 238 aa24.46■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ATPAF2Q8N5M1 289 aa24.46■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa24.46■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PTPRN2Q92932 1015 aa24.46■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FBRSQ9HAH7 460 aa24.46■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SP110Q9HB58 689 aa24.46■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa24.45■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 J3KR12 359 aa24.45■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SP9P0CG40 484 aa24.45■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 VAV1P15498 845 aa24.45■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PTPN7P35236 360 aa24.45■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CETN2P41208 172 aa24.45■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DNA2P51530 1060 aa24.45■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DYNLT1P63172 113 aa24.45■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 IL10RBQ08334 325 aa24.45■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GALNT2Q10471 571 aa24.45■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C9orf64Q5T6V5 341 aa24.45■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ANO7Q6IWH7 933 aa24.45■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LRRC49Q8IUZ0 686 aa24.45■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 OR2T3Q8NH03 318 aa24.45■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HMGB4Q8WW32 186 aa24.45■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DTLQ9NZJ0 730 aa24.45■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EBF1Q9UH73 591 aa24.45■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CST8O60676 142 aa24.44■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PYGMP11217 842 aa24.44■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GABRG2P18507 467 aa24.44■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 COPAP53621 1224 aa24.44■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LLGL1Q15334 1064 aa24.44■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 Q6ZVU0 165 aa24.44■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PRSS33Q8NF86 280 aa24.44■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MDGA1Q8NFP4 955 aa24.44■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KCNH6Q9H252 994 aa24.44■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP24.44■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EFR3BQ9Y2G0 817 aa24.44■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EML5Q05BV3 1969 aa24.43■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 USP27XA6NNY8 438 aa24.43■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MAFKO60675 156 aa24.43■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TMCC1O94876 653 aa24.43■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MAP3K6O95382 1288 aa24.43■■□□□ 1.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NDUFV2P19404 249 aa24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms